Identities computed with respect to: (1) AE000524_Helicobacter_pylori_26695_section_2_of_13
Colored by: consensus/80% and property
  1 AE000524_Helicobacter_pylori_26695_section_2_of_13 100.0%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GCT-------------C-TTATTTAGAC-C-TAT GCAA-T-AGGA--------------------------------------- ----------------------------------T----TTT-AGGGTAA C-GCTTCAGGGTAGGA--ATACAGCAGAGTCC-CC-TAA--T-TTC--TT -G-TGTGCCTTA--GCCAT--CTG-AATAGGAG-TG--C-----TTCA-- -------------------------------------------------- -----------------  
  2 AE001441_Helicobacter_pylori,_strain_J99_section_2  98.2%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GCT-------------C-TTATTTGGAC-C-TAT GCAA-T-AGGA--------------------------------------- ----------------------------------C----TTT-AGGGTAA C-GCTTCAGGGTAGGA--ATACAGCAGAGTCC-CC-TAA--T-TTC--TT -G-TGTGCCTTA--GCCAT--CTG-AATAGGAG-TG--C-----TTCA-- -------------------------------------------------- -----------------  
  3 AE000759_Aquifex_aeolicus_section_91_of_109_of_the  31.0%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GC-------------------------C-C-TGC G-GC-G-GGAC--------------------------------------- ---------------------------------------AGG--GTGAAC T-CCCCCAGGCCCGAA--AGGGAGCAAGGGTAAGC--CC--GCCGT--CC -C--GTG-CGCA--GG----------------G-TC--C-----TAAA-- -------------------------------------------------- -----------------  
  4 AE001151_Borrelia_burgdorferi_(section_37_of_70)_o  34.5%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------CCT---A-------------------GGACCCG-TAC T-AT-C-A-AG--------------------------------------- ----------------------------------T----ATT-GCTGAAT C-CCGTCAGGACTGGA--AGGTAGCAGCGGTA-AG-CGA--T-TTT--TT -T-GATG-AGTA--CGTAA-GTCT---------T-A--GG----TTTA-- -------------------------------------------------- -----------------  
  5 AE001187_Treponema_pallidum_section_3_of_87_of_the  25.8%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -----------C-CGGGGC--------------------CGCCC------ --AC-G-AAAT--------------------------------------- -------------------------------A-------TCC-CCCAAAC C-CCGCTAGGTCCGGA--AGGAAGCAACGGTA-GG-GGG--ACGCT--TC -G--GTG-CGCG---------AT--CC-----GCCC--CG---GTTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
  6 AE001298_Chlamydia_trachomatis_section_25_of_87_of  33.6%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------GTAAGC-----------------TGGGGACC-T-CTT --AA-G-A-TG--------------------------------------- -------------------------------AGAG----ACT-TCTGAAC C-GGGTCAGGATCGGA--AGGTAGCAGCCCTAAGG-ATA---GGCC--TT -T-TGTG-CTAG--GAGTT-TTCT-CTG----GCTT--AC----TTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
  7 AE001624_Chlamydia_pneumoniae_section_40_of_103_of  33.3%  --------------G-----------g-------GTAA------------ -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GTT------------------GGGGGCCTT-TTA AGAG-A-AGGA--------------------------------------- ---------------------------------------ACC-TGCGAAT C-GGGTCAGGACTGGA--AGGTAGCAGCCCTAAGG-AGA--G-TTT--TC -T-TTTGCTAAA--AGAATgTTCT-CC-----A-AC--TTACTCTTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
  8 AE002056_Deinococcus_radiodurans_R1_section_193_of  36.7%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ------------GCATTGC--------------------TGGTG-C-AGC GCAG-C-GCGG--------------------------------------- ---------------------------------------ACG-CCCGAAC C-TGGTCAGAGCCGGA--AGGCAGCAGCCATAAGG-GAT--GCTTT--GC -G-GGTGCCGTT--GCCTT--CCG--------GCAA--TG---CTTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
  9 AE002112_Ureaplasma_urealyticum_section_13_of_59_o  34.5%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------GTCATT---------------------A--C------ --AA-T-A-TT--------------------------------------- ----------------------------------A----AGT-AGCGAAC C-TTGTCAGGCCAGAG--ATGGAGCAGCAATA-GC-AAT--A-TCT--TT -T-TATG-TGT---------------------GATG--AC----ATAT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 10 AE002321_Chlamydia_muridarum,_section_52_of_85_of_  34.7%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ------------GTAAGTC-------------------GGGGACCT-CTT --AA-G-A-TG--------------------------------------- -------------------------------AGAG----ACT-TCTGAAC C-GGGTCAGGATCGGA--AGATAGCAGCCCTAAGG-AAA---GGCC--TT -T-TGTGCTAAG--AGTCT--TCT-CT-----GACT--TA---CTTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 11 NMA4Z2491_Neisseria_meningitidis_serogroup_A_strai  35.6%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGC--------------------GGGTCTC-CCC GCAT-G-GC----------------------------------------- -------------------------------AA------ATC-GGAACAC C-GGGTCAGGGGCGGA--AGCCAGCAGCCCAC-TC-CGG--T-GCG--CC -A--GTGCCGGG--GGTTT-GGC--CC-----GCCG--CCC---TATT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 12 AE002450_Neisseria_meningitidis_serogroup_B_strain  37.3%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGC--------------------GGGTCTC-CCC GCAT-G-GC----------------------------------------- -------------------------------AA------ATC-GGAACAC C-GGGTCAGGGGCGGA--AGCCAGCAGCCCAC-TC-CAA--T-GCG--CC -A--GTGCCGGG--GGTTT-GGC--CC-----GCCG--CCC---TATT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 13 AE003940_Xylella_fastidiosa_9a5c,_section_86_of_22  40.3%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGTG-----G------C-CCTGCCGGTC-C-CTC GCAA-C-GCTA--------------------------------------- ---------------------------------------GAT-CGAAAAC C-CCGCCAGGGCCGGA--AGGCAGCAACGGTA-TT-GAT--TGATG--CG -G--GTGCCGAG--ATCAA--CCG-GTGGG--G-CC--ATCTCCTTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 14 AE004188_Vibrio_cholerae_chromosome_I,_section_96_  35.6%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GG-------G------G-GCCCTGGTCC-T-CCC GCAA-C-ACTA--------------------------------------- ---------------------------------------GTT-CGTGAAC C-TGGTCAGATCCGGA--AGGAAGCAGCCACA-GC-GGA--TGATG--TG -T--GTGCCGGG--ATGTG--GCT-GGGGT----CT--CCGCCCATCT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 15 AE004581_Pseudomonas_aeruginosa_PA01,_section_142_  39.2%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGTG-----G------C-CCTGTCGGTCCC-CCC GCAA-C-GATT--------------------------------------- ---------------------------------------ACC-CGTCAAC C-TGGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCCACA-GC-GGG--A-ACA--TC -G-TGTGCCGGG--GTGTG-GCTG-GCGGG--GCCG--CCTCC-ATTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 16 AE005700_Caulobacter_crescentussection_26_of_359_o  31.9%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGA------G------A-TCGGCG---C------ GGAC-G-GAGT--------------------------------------- ---------------------------------------CCT-CGCCAAC C-TGGTCAGGGCCGAG--AGGCAGCAGCCACA-AC-GAG--ATCAC--CT -C-TGGGTCGT-----------CT-GCCGG--TCTC--CACCTCATTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 17 AE006092_Pasteurella_multocida_PM70_section_59_of_  46.3%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGAAA-----------C-CTTCTCGGTT-C-CTC GCAA-T-GGTG--------------------------------------- ---------------------------------------TCT-GGTTTAC C-CGGTCAGGTTCGGA--AGAAAGCAGCCAAA-GT-CAG--AATTT--CT -G-TGTGCCGAG--ATCAA-GCTG-GGAAG--GTTT--CCACCCAACG-- -------------------------------------------------- -----------------  
 18 AE006489_Streptococcus_pyogenes_M1_GAS_strain_SF37  33.3%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GG-A--------------------G--C------ --AA-C-ACTT--------------------------------------- ---------------------------------------GTG-CGTGAAG T-GGGTCAGGGGAGGA--ATCCAGCAGCCCTAAGC-GAT--TTTCG--GG -T--GTG-TGC-----------------------TC--T-----TTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 19 AE007179_Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551,sectio  35.0%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GG-A----------------CCCCG--CGC-GGC G-TC-----TA--------------------------------------- ---------------------------------------TCC-TGTGAAC T-CCCCCAGGGCTGGA--AGGCAGCAAGGGTCAAC-GGG--CTCTG--TC -G-GGTG-CGCG--GGG-----------------TC--CCC---TTCA-- -------------------------------------------------- -----------------  
 20 AE007951_Agrobacterium_tumefaciens_strain_C58_circ  27.3%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGGA-------------------GGTTGGT-GGT GGACgA-G-CC--------------------------------------- ---------------------------------------ACT-CGCCAAC C-GGGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCCCTA-AC-GAG--CCAGG--CA -C--GGGTCGCC--GTGCC-AGC----------CTC--CCACC-TTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 21 AE008386_Streptococcus_pneumoniae_R6_section_2_of_  36.3%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GG-A--------------------G--C------ --AA-C-AGTT--------------------------------------- ---------------------------------------CTG-CGTGAAG C-GGGTCAGGGGAGGA--ATCCAGCAGCCCTAAGC-GAT--T-TGA--AT -T--GTG-TGC-----------------------TC--T-----TTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 22 AE008680_Rickettsia_conorii_Malish_7,_section_112_  23.6%  ---------GCT-------------------------------------- --------------------AGT--------------------------- -------------------------------------------------- -------------AGTGG----------------------G--C------ --AT-T-GT----------------------------------------- ---------------------------------------ACC-TGTTTAG T-CGGTCAGGTCTGAA--AGGAAGCAGCCAGA-GT-GGG--ATTCG---- -A-TGGGTCATT--------------------ACTA--GC----ATTA-- -------------------------------------------------- -----------------  
 23 AE008717_Salmonella_typhimurium_LT2,_section_25_of  36.9%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGGG-----G------C-TCTGTTGGTTCT-CCC GCAA-C-GCTA--------------------------------------- ---------------------------------------CTC-TGTTTAC C-AGGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCCAAG-GC-AGA--TGACG--CG -T--GTGCCGGG--ATGTA-GCTG-GCAGG--GCCC--CCACCCATTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 24 AF132127_Streptococcus_mutans_sorbitol_phosphoenol  34.5%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GG-A--------------------G--C------ --AA-C-AGCT--------------------------------------- ---------------------------------------TTG-CGTGAAG C-GGGTCAGGGGAGGA--ATCCAGCAGCCCTAAGC-GAT--G-TAA--GC -T--GTG-TGC-----------------------TC--T-----ATTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 25 AF203881_Zymomonas_mobilis_strain_ZM4_clone_43F4,_  39.5%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------GGCGATA----GT------G-GAAGTCGGGC------ GGAC-G-GTGC--------------------------------------- ---------------------------------------TGT-CGCCAAC C-CGGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCCGTA-AC-GAA--T-TTT--TA -T-CGGGTCGTT---------CCG-GCTTCCA-TCG--TC----TTAA-- -------------------------------------------------- -----------------  
 26 AE006305_Lactococcus_lactis_subsp_lactis_IL1403_se  25.7%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GG-A--------------------G--C-A---- --AT-A-AGTT--------------------------------------- ---------------------------------------TCT-TACGAAG C-GTGTCAGGACCTGA--CGGTAGCAGCACTAAGT-ATG----GAG--CT -T--ATG-TGC-----------------------TC--T-----TTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 27 AJ414155_Yersinia_pestis_strain_CO92_comp_genome;_  35.8%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGA----GGC------C-CTGTTGGTTC-T-CCC GCAA-C-ACTA--------------------------------------- ---------------------------------------ACT-TGTGAAC T-CGGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCCGCA-GC-AGG--CGAGG--TG -T--GTGCCGGG--ATGTA--GCT-GGCAGG-GCCT--CCACC-AATT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 28 AL627266_Salmonella_enterica_serovar_Typhi_(Salmon  36.1%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGGG-----G------C-TCTGTTGGTTCT-CCC GCAA-C-GCTA--------------------------------------- ---------------------------------------CTC-TGTTTAC C-AGGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCCAAG-GC-AGA--TGACG--CG -T--GTGCCGGG--ATGTA-GCTG-GCAGG--GCCC--CCACCCAATT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 29 AP001119_Buchnera_sp_APS_genomic_DNA,_comp_seq,_se  37.3%  --------------G----------------------A------------ -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GTT-------------A-TCTGTTAGCT-C-CAA ACAC-T-GC----------------------------------------- -------------------------------AA------TAT-TGAATAG T-TGGTCAGATTCGGA--AGGAAGCAGCCAAA-TC-AAT--T-GAT--AC -A-GGTGTTCTG--ATAAA-GCTA-ACAGA--A-AC--TCC---TAAA-- -------------------------------------------------- -----------------  
 30 AP002551_Escherichia_coli_O157:H7_DNA,_comp_genome  36.9%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGGG-----G------C-TCTGTTGGTTCT-CCC GCAA-C-GCTA--------------------------------------- ---------------------------------------CTC-TGTTTAC C-AGGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCCAAG-GC-AGA--TGACG--CG -T--GTGCCGGG--ATGTA-GCTG-GCAGG--GCCC--CCACCCATTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 31 AP003006_Mesorhizobium_loti_DNA,_comp_genome,_sect  24.8%  ---------GGG-------------------------------------- -------A---G--------GTT--------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGT------G------G-TGGA-----C------ --GA-T-CC----------------------------------------- ---------------------------------------ACT-CGCCAAC C-GGGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCCCTA-AC-GAG--CCCGGaaCG -G-GTCATTGT---------------TCCA--GCCT--CCCACCTCAT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 32 AP003584_Nostoc_sp_PCC_7120_DNA,_comp_genome,_sect  33.9%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GAC------------------CTGGATC-TaTGC G-AC-T-G-CA--------------------------------------- ---------------------------------------ACG-CCTAAAC C-TTGTCAGGACCGGA--AGGTAGCAGCAACACAG-GAT--GCTTG--TG -G-TAGG-CGTA-----GT-CTCC-GG-----GTCG--CCC---TATT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 33 CJ11168X1_Campylobacter_jejuni_NCTC11168_comp_geno  67.6%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GCC-------------T-TTTCTTAGAC-C-TGT GCAA-T-GCTA--------------------------------------- ----------------------------------T----TTT-TAAGCAC C-GCTTCAGGGTGGGA--ACACAGCAGAGCAC-TT-GAT--T-TTA--GT -G-TGTGCCGCA--GTTAT--CTG-GGGAA--G-GG--T-----TTTA-- -------------------------------------------------- -----------------  
 34 HD32175_Haemophilus_ducreyi_hemolytic_cytotoxin_Hh  42.9%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GG-----GGT------A-TTATTGGTT--T-CTC GCAG-C-AGAA--------------------------------------- ---------------------------------------TTC-AGCTTAC T-TAGTCAGGGCCGGA--AGGAAGCAGCTTGG-GT-TGA--A-TTT--CT -G-GGTGCCGGG--AG--T-CGCT-GGTAAT-A-CC--CCACC-TTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 35 HI32795_Haemophilus_influenzae_Rd_section_110_of_1  41.3%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGAAA-----------C-CTTCTCGGTC-T-CTC GCAA-C-GGTG--------------------------------------- ---------------------------------------TCT-GGTTTAC T-CGGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCCAAA-GT-CGG--AATTA--CT -G-TGTGCCGAG--AAGAA-GCTG-GGAAG--GTTT--CCGCCCAACT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 36 LP45SRNA_Lpneumophila_45S_RNA_homolog               39.3%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGTGA---CT------C-TATT-GGTCC-C-CTC GCGA-C-GATA--------------------------------------- ---------------------------------------GAT-TGTGAAC C-CCGTCAGGCCCGGA--AGGGAGCAGCGGTA-GC-AGT--TGATG--CG -G--GCGCCGGG--GTGTG--GCT--CTTAGAGTCG--CCGCCCAACT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 37 MCSRNA_Mycoplasma_capricolum_gene_for_small_RNA     29.6%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ---------------AGCC---------------------G--C------ GATA-A-G-AA--------------------------------------- -------------------------------TA------ACA-TCTGAAT --GAGTTAGGACCGGA--AGGTAGCAGCTATAAGG-AAA--A-GTG--TT -C-TGTATTGCG--------------------G-TT--------TTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 38 MG39706_Mycoplasma_genitalium_section_28_of_51_of_  27.7%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------AAC------------------------C---ATC A-CA-T-CATT--------------------------------------- ---------------------------------------AGA-GTCGAAT C-ATGTCAGGCCAGAA--ATGGAGCAGCATTAAGA-CTT--G-TCA--GT -G-AGTG-TGAT--------------------G-GT--T-----TTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 39 ML45SRNA_Mlysodeikticus_45S_RNA_homolog             28.9%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ---------------GGCC---------------------C--C-T---- --AC---GTGGTGT------------------------------------ --------------------------C-A-T--------CTC-GCTGAAC TtCCCCCAGGACCGGA--AGGTAGCAAGGGTA-GG-TGG--GCTCT--GG -CaGGTG-CGTG--AGGG--------------G-TC--------TTCA-- -------------------------------------------------- -----------------  
 40 MLEPRTN9_Mycobacterium_leprae_strain_TN_comp_genom  31.6%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GG-A----------------CCCCG--CGC-GGC G-TC-----TA--------------------------------------- ---------------------------------------TCC-TGTGAAC T-CCCCTAGGGCCGGA--AGGCAGCAAGGGTCAAT-GGG--CTCTG--TC -G-GGTG-CGCG--GGG-----------------TC--CCC---TACC-- -------------------------------------------------- -----------------  
 41 MM45SRNB_Mmycoides_45S_RNA_gene                     27.0%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------------------------------G--C---CGC GATA-A-G-AA--------------------------------------- -------------------------------TA------ACA-TCTGAAC --GAGTTAGGACCGGA--AGGTAGCAGCTATAAGG-AAA--A-GTG--TT -C-TGTATTGCG--------------------GT----------TTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 42 MPAE44_Mycoplasma_pneumoniae_M129_section_36_of_63  28.3%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -----------A-GCCGTCA-----------------------C------ --AT-C-A-TT--------------------------------------- ---------------------------------------ACG-GTCGAAT C-ATGTCAGGCCAGAA--ATGGAGCAGCATTAAGA-CTA--TTTAA--TG -A--GTG-TGA-----------------------TG--GT---TTTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 43 MPULM03_Mycoplasma_pulmonis_(strain_UAB_CTIP)_comp  34.8%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GC-------------------------C---TTT AGAA-C-AATA--------------------------------------- ---------------------------------------ACC-TCATAAC C-CGGTCAGGACAGAA--ATGGAGCATCCGCATTG-AGA--A-GTG--TT -G-TGTCTTTAG--------------------G-TC--------TTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 44 PMA237851_Prochlorococcus_marinus_ddlb_(partial),_  31.1%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GAC-------------------TCGGGC-----C CATG-C-G-GC--------------------------------------- -------------------------------TTCG----ACG-CCTAAAT C-TGGTCAGGACCGGA--AGGTAGCAGCCACAAGG-GAT---GCTT--GA -A-TCTGGCGT----GGAT-TCCG-G------G-TC--ACC---TAAA-- -------------------------------------------------- -----------------  
 45 PSP011025_Prochlorococcus_sp_ftsZ_gene_and_genes_e  29.3%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GAC-------------------TCGGCC-T-TTC --GC-G-GTTT--------------------------------------- -------------------------------TA------ACG-CCCAAAC C-TGGTCAGGATCGGA--AGGTAGCAGCCACAAGG-GAT----GCT--TG -A-GGCA-GGCG--AGATA-ACCG-A------GTCA--C-----TTAA-- -------------------------------------------------- -----------------  
 46 RPXX04_Rickettsia_prowazekii_strain_Madrid_E,_comp  27.6%  ---------GCT-------------------------------------- --------------------AGT--------------------------- -------------------------------------------------- -------------AGTGG----------------------G--C------ --AT-T-GC----------------------------------------- ---------------------------------------TCT-TGCTTAG T-TGGTCAGGTCTGAA--AAGAAGCAGCCAGG-GT-AAG--ATTCT---- -G-TGGGTCATT--------------------ACTA--GT----ATCA-- -------------------------------------------------- -----------------  
 47 SCD25_Streptomyces_coelicolor_cosmid_D25            27.0%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GCC---------------CCTCACG--CGG-CGC TA------T----------------------------------------- ---------------------------------------CTG-ACTGAAC T-CCCCCAGGGCCGGA--AGGCAGCAAGGGTA-GG-TCG--GCTCT---- -G-GCGGGTGCG--TGG--------GGGGC--G-TC--TCC---TTTG-- -------------------------------------------------- -----------------  
 48 SME591782_Sinorhizobium_meliloti_1021_comp_chromos  30.8%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGGA-------------------GGTTGGT-GGT GGAC-G-AGCC--------------------------------------- ---------------------------------------ACT-CGCCAAC C-GGGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCCCTA-AC-GAG--CCCCG--GC -A-CGGGTCATC--GTGCC-AGC----------CTC--CCACC-TTCT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 49 SSD912_Synechocystis_sp_PCC_6803_DNA,_comp_genome,  38.3%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GGC-------------------TCGGACTCaTGC G-AT-T-A-CA--------------------------------------- ---------------------------------------ACG-CCCAAAT C-TTGTCAGGACCGGA--AGGTAGCAGCAATAAGG-GAT--GCTTG--TG -G-TAGG-CGT---GAACT--CCG-G------GCTT--CCGGC-TTTT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 50 TT45SRNA_Thermus_thermophilus_ffs_gene_for_45S_RNA  37.0%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GC------------------CCCCGGTC-C-AGC GCGG-C-GGGC--------------------------------------- -------------------------------C-------AGG-CGTGAAC C-GGGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCCCTAAGC-GCC--TCGGT--CC -G-GGCGCCGCT--GGGAA-GCCG-GGG----G-CG--CTTCC-TTGG-- -------------------------------------------------- -----------------  
 51 Neisseria_Gonorrhoeae                               36.7%  -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ----------------GC---------------------GGGTCTC-CCC GCAT-G-GC----------------------------------------- -------------------------------AA------ATC-GGAACAC C-GGGTCAGGGGCGGA--AGCCAGCAGCCCAC-TC-CGA--T-GCG--CC -A--GTGCCGGG--GGTTT-GGTC----------CG--CCGCCCTATT-- -------------------------------------------------- -----------------  
 52 AP001507_Bacillus_halodurans_g                      17.5%  CCGTGCTAGGTG--GGGAGG-TAGCGG-TGCCCTGTCACTCG--C--A-A TCCG-CTAT-A--GCGAG---GCT-G------------------AATCCC -TT-C---TA--GAGGTTTT---G-----------TCACCGTAGGGTC-T G--CCCTAAGTA-AGTGGTGT---TG------A-CGCTTGGGTT-C-TAC GCAA-C-GAAA--------------------------------------- ---------------------------------------ACC-CACGAAC C-CTGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCAGTAAGT-GGC--CCCTT--TC -G-TGTGCCGTA--GAGTC-GCCT-GGGCCGAGCTA--AC---TGCTCA- G-Gt-AA-C---GCCTAG-G-GT--GG---------CATGATCG-AAG-- GAAGG-----TGCACGG  
 53 BAALSCR_B_alcalophilus_gene_fo                      16.6%  CCGTGCTAAGCG--GGGAGG-TAGCGG-TGCCCTGTA-CTCG--C--A-A TCCG-CTAT-A--GC-AG---GCT-G------------------AATCCC -TT-C---TA--GAGGTTTT---G-----------TCACCGTAGGCTC-T G--CCCTAAGTA-AGTGGTGT---TG------A-CGTTGGGTTC---TAC GCAA-C-GAAA--------------------------------------- ---------------------------------------ACC-CACGAAC C-CTGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCAGTAAGT-GGC--CCCTT--TC -G-TGTGCCGTA---GAGT-CGCT-GGGCCGAGCTA--AC---TGCTCA- G-Gt-AA-C---GC-TAG-G-GT--GG---------CATGATCG-ACA-- GAAGG-----TGCACGG  
 54 BAASCR_B_amyloliquefaciens_gen                      20.7%  CCGTGCTAAGCG--GGGAGG-TAGCGG-TGCCCTGTA-CCTG--C--A-A TCCG-CTCT-A--GCAGG---GCC-G------------------AATCCC -TT-C---TC--GAGGTTCGt--------------TTACTTTAAGGCC-T G--CCTTAAGTA-AGTGGTGT---TG------A-CGTTTGGGTC-C-TGC GCAA-T-GGGA--------------------------------------- ---------------------------------------ATT-CATGAAC C-ATGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCATTAAGT-GAA--ACCTC--TC -A-TGTGCCGCA--GGGTT-GCCT-GGGCCGAGCTA--AC---TGCTTA- A-Gt-AA-C---GCTTAG-G-GT--AG----------CGAATCG-ACA-- GAAGG-----TGCACGG  
 55 BBSCRNA_Bacillus_brevis_gene_f                      19.3%  CCGTGCTAGACG--GGGAGG-TTGCGG-TGCCCTGTAACCTG--C--A-A TCCG-CAATAG--CCAGG---GTGtG------------------AATTCC -TA-T---CC--TAGG-TTTt--------------CTTATGTGAGGC--T GccGTTGATGGC-GGCGGTGT---TG------A-GGAGCGGGTC-C-TGT GCAA-C-GCGA--------------------------------------- ---------------------------------------ACC-CATGAAC C-TGGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCCATAAGT-GGA--TCATC--GC -G-TGTGCCGCA--GGGTA-GCCT-GCTCTGAGCTG--CT---ACCATA- A-Gt-A----ACGCTCGG-A-TA--AGg---------ATTATCG-AAG-- ATAGG-----TGCACGG  
 56 BCCISCR_B_circulans_gene_for_s                      18.4%  CCGTGCTAAGCG-GGGGAGG-TAGCGG-TGCCCTGTA-CTCG--C--A-A TCCG-CTCT-A--GCGAG---GCT-G------------------AATTCC -TT-T---CT--GAGGCTGGt--------------ATCCTGTAGGGTC-T G--CCTTAAGTA-AGTGGTGT---TG------A-CGTCCGGGTC-C-TGC GCAA-T-GGGA--------------------------------------- ---------------------------------------ATC-CATGAAC C-ATGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCATTAAGT-GGA--CACCC--CC -A-TGTGCCGCA--GGGTT-ACCT-GGACTGAGCTA--AC---TACTTA- A-Gt-AA-C---GCTTAT-G-GG--TG-----------CCAGTCGACA-- GAAGG-----TGCACGG  
 57 BCCSCR_B_cereus_gene_for_small                      17.0%  CCGTGCTAAGCG-GGGGAGG-TAGCGG-TGCCCTATA-CTCG--C--A-A TCCG-CTCT-A--GC-AG---GCC-G------------------AATCCC -CT-C---TC--GAGGTTATg--------------TTGCTGTAAGGTC-T G--CCTTAAGTA-AGTGGTGT---TG------A-CGTTTGGGTC-C-TGC GCAA-C-G-GG--------------------------------------- ---------------------------------------ACC-CGTGAAC C-TTGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCAATAAGC-GGT--CTTCT--CG -T--GTGCCGAG--AG--T-GCCT-GAACCGAGCTA--AC---TGCTTG- A-Gt-AA-C---G-TTAT-G-GT--AC----------GTAATCG-ACA-- GAAGG-----TGCACGG  
 58 BMMASCR_B_macerans_gene_for_sm                      19.9%  CCGTGCTAAGCA-GGCGAGG-TAGCGG-TGCCCCATA-CCCG--C--A-A TCCG-CTCT-A--GGAGG---GCC-G------------------AATCCC -TT-C---TC--GAGGTTCGt--------------TTACTGTAAGGTC-T G--CCTTAAGTA-AGTGGCGT---TG------A-CGTCTGGGTC-C-TGC GCAA-T-GGGA--------------------------------------- ---------------------------------------ATT-CATGAAC C-ATGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCATTAAGT-GAA--ACCTC--TC -A-TGTGCCGCA--GGGTT-GCCT-GGGCTGAGCTA--AC---TGCTTA- A-Gt-AA-C---GCTTAG-G-GT--AG----------CGAATCG-ACA-- GAAGG-----AGCACGG  
 59 BMMSCR_B_megaterium_gene_for_s                      20.8%  CCGTGCTAAGCG--GGGAGG-TAGCGG-TGCCCTGTA-CTCG--C--A-A TCCG-CTCT-A--GC-AG---GCC-G------------------AATTCC -TT-C---TT--GAGGTTAGc--------------TCATCTTAGGGCC-T G--CCTTAAGTA-AGTGGTGT---TG------A-CGTTTGGGTC-C-TAC GCAA-T-GGGA--------------------------------------- ---------------------------------------ATC-TGTGAAC C-CTGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCAGTAAGC-AGA--ACCTC--TC -A-TGTGCCATG--GGGTC-GCCT-GAACCGAGCTA--AC---TGCTTA- A-Gt-AA-C---GCCTGG-G-GT--GG----------CTAATCG-ACA-- GAAGG-----TGCACGG  
 60 BPPOSCR_B_polymyxa_gene_for_sm                      20.6%  CCGTGCTAAGCG-GGGGAGG-TAGCGG-TGCCCTGTA-CCTG--C--A-A TCCG-CTCT-A--GCAGG---GCC-G------------------AATCCC -TT-C---TC--GAGGTTCGt--------------TTACTTTAAGGCC-T G--CCTTAAGTA-AGTGGTGT---TG------A-CGTTTGGGTC-C-TGC GCAA-T-GGGA--------------------------------------- ---------------------------------------ATT-CATGAAC C-ATGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCATTAAGT-GAA--ACCTC--TC -A-TGTGCCGCA--GGGTT-GCCT-GGGCCGAGCTA--AC---TGCTTA- A-Gt-AA-C---GCTTAG-G-GT--AG----------CGAATCG-ACA-- GAAGG-----TGCACGG  
 61 BPPSCR_B_pumilus_gene_for_smal                      20.8%  CCGTGCTAAGCG--GGGAGG-TAGCGG-TGCCCTGTA-CTCG--C--A-A TCCG-CTCT-A--GC-AG---GCC-G------------------AATCCC -TT-C---TC--GAGGTTCGt--------------TTACTTCAAGGTC-T G--CCTTAAATA-AGTGGTGT---TG------A-CGTCTGGGTC-C-TGC GCAA-T-GGGA--------------------------------------- ---------------------------------------ATT-CATGAAC C-ATGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCATTAAGT-GAA--ACCTC--TC -A-TGTGCCGCA--GGGTT-GCCT-GGGCCGAGCTA--AC---TGTTTA- A-Gt-AA-C---GCTTGG-G-GT--AG----------CGAATCG-ACA-- GAAGG-----TGCACGG  
 62 BSORF17_Bacillus_subtilis_DNA_                      20.7%  CCGTGCTAAGCG--GGGAGG-TAGCGG-TGCCCTGTA-CCTG--C--A-A TCCG-CTCT-A--GCAGG---GCC-G------------------AATCCC -TT-C---TC--GAGGTTCGt--------------TTACTTTAAGGCC-T G--CCTTAAGTA-AGTGGTGT---TG------A-CGTTTGGGTC-C-TGC GCAA-T-GGGA--------------------------------------- ---------------------------------------ATT-CATGAAC C-ATGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCATTAAGT-GAA--ACCTC--TC -A-TGTGCCGCA--GGGTT-GCCT-GGGCCGAGCTA--AC---TGCTTA- A-Gt-AA-C---GCTTAG-G-GT--AG----------CGAATCG-ACA-- GAAGG-----TGCACGG  
 63 BSSCR_Bacillus_stearothermophi                      18.8%  CCGTGCTAAGCG--GGGAGG-TAGCGG-TGCCCTGTA-CTCG--C--A-A TCCG-CTCT-A--GCGAG---GCT-G------------------AATCCC -TT-C---TC--GAGGTTAGt--------------CTGTTGTGAGGCC-T G--TCTCAAGTA-AGTGGTGT---TG------A-CGTCTGGGTC-C-CGC GCAA-T-GGGA--------------------------------------- ---------------------------------------TTC-CGTGAAC C-CTGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCAGTTAGC-GGA--TGCTC--CC -A-TGTGCCGCG--GGGGC-GCCT-GGGCTGAGCCA--AC---TGCTTG- A-Gc-AA-C---GCTCGG-G-GC--AG----------CTAATCG-ACA-- GAAGG-----TGCACGG  
 64 BSSPSCR_B_sphaericus_gene_for_                      20.7%  CCGTGCTAAGCG--GGGAGG-TAGCGG-TGCCCTGTA-CCTG--C--A-A TCCG-CTCT-A--GCAGG---GCC-G------------------AATCCC -TT-C---TC--GAGGTTCGt--------------TTACTTTAAGGCC-T G--CCTTAAGTA-AGTGGTGT---TG------A-CGTTTGGGTC-C-TGC GCAA-T-GGGA--------------------------------------- ---------------------------------------ATT-CATGAAC C-ATGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCATTAAGT-GAA--ACCTC--TC -A-TGTGCCGCA--GGTTG-CCTT-GGGCCGAGCTA--AC---TGCTTA- A-Gt-AA-C---GCTTAG-G-GT--AG----------CGAATCG-ACA-- GAAGG-----TGCACGG  
 65 BTTSCR_B_thuringiensis_gene_fo                      20.7%  CCGTGCTAAGCG--GGGAGG-TAGCGG-TGCCCTATA-CTCG--C--A-A TCCG-CTCT-A--GC-AG---GCC-G------------------AATCCC -CT-C---TC--GAGGTTAT---G-----------TTGCTGTAAGGTC-T G--CCTTAAGTA-AGTGGTGT---TG------A-CGTTTGGGTC-C-TGC GCAA-C-GGGA--------------------------------------- ---------------------------------------CCC-CGTGAAC C-TTGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCAATAAGC-GGG--TCTTC--TC -G-TGTGCCGCA--GGAGT-GCCT-GAACCGAGCTA--AC---TGCTTG- C-Gt-AA-C---GCTTAT-G-GC--TA---------CGCAATCG-ACA-- GAAGG-----TGCACGG  
 66 AE007525_Clostridium_acetobuty                      20.5%  --GTGCTAGACG--GGGAGT-TAGCGG-TGCCTTGTA-CCTG--C--A-A TCCG-CTGT-A--GCAGG---GTT-G------------------AATTCC -TT-G---TT-TGAGG-CTAt--------------AATTTGTGGGGTT-T G--CCTCATCTTGGTCAATGT---TG------A-GAATTGGGTC-C-CAC GCAA-C-GGAA--------------------------------------- ---------------------------------------ATT-CATGAAC T-CCGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCGGTAAGT-GAA--ATCTT--CC -G-TGTGCCGTG--GATAA-ATCT-GATTTGAGTTG--AC--CAG-GTG- A-Gt-AA-C---ACTCAT-A-GA--TT----------ATTGTCG-ATT-- CAAGG-----TGCAC--  
 67 CPSERTRNA_Clostridium_perfring                      19.5%  CCGTGCTAGATG--GGGAGT-TAGCGG-TGCCCTGTAACCTG--C--A-A TCCG-CTAC-A--GCAGG---ATC-G------------------AAGTCC -TC-A---TA--GAGG-CTCt--------------AACTTGTGGAGTC-T G--CCCTATGTA-AGTGGTGT---TG------A-GAGTTGGGCC-C-CAC GCAA-T-GGAA--------------------------------------- ---------------------------------------ACC-TGTGAAC C-TCGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCGATAAGC-AGT--CATTT--TC -A-TGTGCCGTG--GATAC-GTCT-GGCTTGAGCTA--AC---TGCATA- G-Gt-AA-C---GTTCAT-A-AG--TT----------ATTGTCG-AAG-- TGAGG-----TGCACGG  
 68 AF269814_Staphylococcus_epider                      19.9%  CCGTGCTAGGTG--GGGAGG-TAGCGG-TTCCCTGTA-CTCG--A--A-A TCCG-CTTTAT--GCGAG---ACT-T------------------AATTCC -TT-T---GT-TGAGGACGTa--------------TTTTTGTGAAGTC-T G--CCCGAAGCA-CGTAGTGT--TTG------AaGATTTCGGTC-C-TAT GCAA-T-ATGA--------------------------------------- ---------------------------------------ACC-CATGAAC C-ATGTCAGGTCCTGA--CGGAAGCAGCATTAAGT-GGA--TCCTC--AT -A-TGTGCCGTA--GGGTA-GCCG-AGATTTAGCTG--TC---GACTTC- G-Gt-AA-C---GTTTAT-G-AT--AT----------GCGTTCGATAC-- AAAGG-----TGCATGG  
 69 AF368293_Staphylococcus_aureus                      19.9%  CCGTGCTAGGTG--GGGAGG-TAGCGG-TTCCCTGTA-CTCG--A--A-A TCCG-CTTTAT--GCGAG---GCT-T------------------AATTCC -TT-T---GT-TGAGGCCGTa--------------TTTTTGCGAAGTC-T G---CCCAAAGCACGTAGTGT--TTG------AaGATTTCGGTC-C-TAT GCAA-T-ATGA--------------------------------------- ---------------------------------------ACC-CATGAAC C-ATGTCAGGTCCTGA--CGGAAGCAGCATTAAGT-GGA--TCATC--AT -A-TGTGCCGTA--GGGTA-GCCG-AGATTTAGCTA--AC--GACTTTG- G-T--TA-C---GTTCGT-G-AA--TT----------ACGTTCGATGC-- TTAGG-----TGCACGG  
 70 AL591984_Listeria_monocytogene                      20.1%  --GTGCTAGACG--GGGAGG-TAGCGG-CGCCCTGTAACCCG--C--A-A TCCG-CTCT-A--GCGGG---GTT-G------------------AATTCC -TC-A---TT-TGAGGCATCg--------------TAATTGTTTGGTC-T G--CCCTTGACA-AGTGGTGT---TG------A-AGGTTGGGTC-T-TGC GCAA-T-GGGA--------------------------------------- ---------------------------------------ACC-TGTGAAC C-ATGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCATTAAGC-AGT--GCTTC--TC -A-TGTGCCGCG--AGGTC-GCCT-GGCCCGAGCTA--AC---TATCAG- G-Gt-AA-C---GCAGAT-G-AT--TG-----------CATGTCGATG-- TGAGG-----TGCGC--  
 71 AL596173_Listeria_innocua_Clip                      20.5%  --GTGCTAGACG--GGGAGG-TAGCGG-CGCCCTGTAACCCG--C--A-A TCCG-CTCT-A--GCGGG---GTT-G------------------AATTCC -TC-A---TT-TGAGGCATCg--------------TAATTGTTTGGTC-T G--CCCTTGACA-AGTGGTGT---TG------A-AGGTTGGGTC-T-TGC GCAA-T-GGGA--------------------------------------- ---------------------------------------ACC-TGTGAAC C-ATGTCAGGTCCGGA--AGGAAGCAGCATTAATC-AGT--GCTTC--TC -A-TGTGCCGCG--AGGTT-GCCT-GGCCCGAGCTA--AC---TATCAA- G-Gt-AA-C---GCAGGT-G-AT--TG-----------CATGTCGAGG-- TGAGG-----TGCGC--  
 72 AE001769_Thermotoga_maritima_s                      18.0%  CCACGCTAGGCG--GGGGGC-TGGCGG-TCCCCTGTA-CCCG--A--A-A TCCG-CCGTAC--GCGGG---GCC-G------------------AATTCC -CA-C---CC--GAGGCTCTt--------------CGGGTCGGGAAAC-G G---CGTGACTC-GGGGGCGA---TG------A-AGACCGGGTC-C-CAC GCAA-C-GGAA--------------------------------------- ---------------------------------------CCC-TGTGAAC C-TGGTCAGGCCCGGG--AGGGAGCAGCCATAAGC-AGG--TGTTT--CC -G-TGTGCCGTG--GGGGA-GCCC-GGTTGGAGCCT--TC---CGATCA- T-G--CA-C---GCCCCG-G-TC--CGg---------AGAAGTCGACG-- GTGGG-----TGCGTGG  
 73 PORG7SA_Pyrodictuim_occultum__                      10.8%  --CGGGTAGGGC-CGGGGGC-TCGCCC-TCCCCCGAGCCCCG--A--A-A TGGG-CGTAAT--GCGGG--GGCCaG-----------------TAACCCG -CA-C---GT--CGGCCGTA---GtGGTCCAG---GG------------C A---GACCCGGC-CG-ACCCA---TG------A-CCCC-CGTCC-C-GCG GGGC-C-GGCG-----GCGCG-G-------AGCCCCC--TCCGGAGGG-- A---------GGGaGGC-TACCGCCCT----TA------CCG-GGGGAAC C-AGGCCAGGCCCGGA--AGGGAGCAACCTAA-CC-CCG--G-ACG--CC -C-GGCGTTCGC--GGGGC-CACG--GGGTGAG-GCaaCG---GCCGGG- C-C--CC-Ct------------Gcc---CTGGGCC-CCTACGGCTGGC-- GTGCGGGG---GCCG--  
 74 AE006647_Sulfolobus_solfataric                      11.4%  --CAGGGAGGGT-GGGGGATCTCGCCA-ATCCCTATTACCCG--C--A-A --GG-CGTAAT--GCGGG--CACCaG-----------------TAACTCC -TA-C---CC--TATGGTGTc-----------------TCCTATCTGT-A G--GTCCCAGT--GGAGC-GA---TG------A-AGGC-TGCCC-A-GCG GGGCtT-GGCG----GTCATG-G------GCTTTCTC--TCCGGAGGG-- A---------GAG-AAAGTACCATG-A----TA------GCT-GGGGGAA T-CGGCGAGGCCCGGA--AGGGAGCAGCCGTG-CC-TGG----ACG--CC -A--GCGTTCGC--TGGTC-AACA--GCCAGAG-TG--AA----ACTGG- G-Gt-AA-A-CCT-ATAGAT-AG--G-----------TAGGCCATGGG-- GTAGGGGGT---CTG--  
 75 AP000988_Sulfolobus_tokodaii_g                       9.9%  --CGGGTAGGGT-GGGGAGTCTCGCCA-GCTCCTGTAACCCCgt------ --GG-CGTAAT---GGGG--CACCaG-----------------TAACCCT -TA-T---GC--CATGATACc--------------TACCTCTCTA----- G---ATCCCAG--CTGAACGA---TG------A-GCAC-CGCCC-G-GTG GGGCgA-GACG----GACGCG-A------ATCTCCTC--TCTGGAGGG-- A---------GAG-GGGATATCGCG-T----CA------ACC-GGAGGAA T-CGGCCAGGTCCGGA--AGGGAGCAACCGTG-TC-CGG----CCG--TC -C--GCGTTCAC--CGGTC-ACCG--GTGTGAGAAA--GG----CTGGG- G-G--TA-A-ATCTAGAG-A-GG--AA----------AGGATCATGGC-- ATAAGGGG---GCCG--  
 76 SS7SRNA_UNKNOWN_Sulfolobus_rel                      13.2%  --CAGGTAGGGT-GGAGGGTCTCGCCA-GCCCTTATA-CCCA--C--At- --GG-CGCAAC--GTGGG--CACCaG-----------------TAACTCC -TA-T---GC--TATA---------A---------TACCTGCTCTTCG-A ---GATCCCAG--TCTAACTA---TG------A-TCAT-CGCCC-G-ACG GGGCgA-GATA----GTCGTG-G------GTTCCCTT--TCTGGAGGG-- A---------GAG-GGAATTCCACG-T------TG----ACC-GGGGGAA C-CGGCCAGGCCCGGA--AGGGAGCAACCGTG-CC-CGG----CTA--TC -C--GCGTTCGT--CGGTC-TCCG--ATAGGAGGAA--GA----CTGGG- G-Gt-AA-A-TCTCGGGG-A-GT--AA------G-----GGTTATGGC-- ATAGGGGA---GCTG--  
 77 AE001042_Archaeoglobus_fulgidu                      13.4%  --GGGCTAGGCC--GGGGGGTTCGGCG-TCCCCTGTAACCCG--A--A-A CCGC-CGATAC--GCGGG--GGCC-G------------------AA-GCC -GA-G---GG--GAGGCCTGt--------------CAAGCGGGCGGCAgC G--GTTCCAGGC-ACCGCA------G------A-GTCCTCGTCC-C-GGA GGGC-C-GGCG----GTTATG-G------CCGGGCTG--CCCGGAGGG-- G---------CTG-TCC--GCCATA-T----TA-G----CCG-GGGGGAA C-GGCCCAGGCCCGGA--AGGGAGCAGGCTAA-CC-CCG--G-ACG--AC -C-GGCGCTTCC--GGGGG-TGCG-GGGAG--G-AG--GT---GCCTGG- G-Gc-TT-CaAGCCGCCC-G-TA--AG----------GCAGGTCGACC-- CGAGGCG---TGCCC--  
 78 AE005009_Halobacterium_sp_NRC1                      12.5%  --GGACTAGGCC--GGGCGGTTTGGCT-CCGCCCGACACCCG--Tg-AgA CAGT-CATC-A--GCGGG--GGCC-G------------------AA--CA cCG-G---GC--GCGTCCGAc-----------------CGCCGCGGTC-G G---GCCCCGGAAGCCAACGT---GG------A-AGCCTCGTCC-G-TCG GGGA-C-GGCG----GTCCGC-G-------GCGTGCG--CCCGCAGGG-- G---------CGT-TCC-GTCGTGG------TTCG----ACG-GTGGCAA C-CCGCCAGGCACGGA--AGTGAGCAGCGGAC-CA-CCG---AACG--CC -C-GTCGCTCGA--CGGGT-CGCG-GGGTGGAGAAG--GC--GACCGGG- A-C--TA-C---CCGGCCGG-GA--AC----------GCCGGGCTACC-- CCG--AC---TGTCC--  
 79 AF395888_Haloferax_volcanii_si                      14.1%  --GGACTAGGTC--GGGCAGTTAGGCC-CTGCTCTTCACCCG--CgaA-A TAGGtCTTT-A--GCGGG--GACC-G------------------AA--CA -CG-G---GC--GCGTCCGG---------------TCAGACCGGCGC--G G---GCCCCGGAAGCCAACGT---AG------A-AACCTCGTCC-T-TCG GGGA-CaGCGG----TTCCGC-G-------TACCCCT--TCCGCAGGG-- A---------AGG-GTT-CGCGCGG-T----TT-A----TCG-GTGGTAC C-CCGCCAGGCGCGGA--AGCGAGCAGCGGAC-CA-TCG--G-ACG--TG -C-GTCGCTCGA--GGGAT-CGCG-GGGTGGAGGAG--GC--AACCGGG- A-Tt-C----CCCACGTCGG-AA--CG-----------CCGGGCAACC-- TC---GC---TGTCC--  
 80 MFTGSRNA_Mfervidus_7S_RNA__Ser                      13.5%  --AGGCTAGGCC--GGGGGGTTAGGGG-TCCCCTGTAAGCGC--A--A-A TCCC-CTATAT--GGCGC--GGCC-G------------------AAGCCC -AG-G---AG--GCGGCAAGa--------------CCGCCAGACA--T-C G---GCCTGAGGGTTAAACAA---TG------A-AGCCTCGTCC-C-ACA GGGC-C-ACCG----GTGGCG-A-------GGGTCCA--GCTGGAGGG-- C---------TGG-ACCTAATCGCC-T----TT-G----CTG-CGGGAAC --GGGTCAGGCCCGGA--AGGGAGCAGCCCTA-CC-GCA--G-ACG--GA -T-GGTGCTTGT--GGGTC-AACG-GGGTGGAGTCT--ATAACCCTCAG- A-T--CA-C-CGGTGTCT-G-GT--GG----------TCTTGTCCACT-- CCTGGGCG--TGCCT--  
 81 MTRRNOPE_Methanobacterium_ther                      13.6%  --GGGCTAGACC--GGAGGGTTAGGGG-TCCTCTGTAAGCGC--A--A-A TCCC-CTATAC--GGCGC--GGTC-G------------------AAGTTC -AG-G---GG--ACGGCTGAt--------------CGACTGTTTA--T-C G---GCCCTGCTGATTGGTGT---CG------A-AGCCTCGTCC-C-GCA GGAT-C-AGTG----GTGATG-G-------GGCCCTG--ACTGGAGGG-- T---------CAG-GGTAAACCATC-T----TA-G----TCA-TGGGAAC --GGGTCAGGCCTGGA--AAGGAGCAGCCCTA-CC-ATG--G-ACA--GC -T-GATGCTTGC--GGATT-AACG-GGGTGGAGCCA--GT--CAGCGGG- A-T--CA-C-CGGTAAAT-G-GA--AG----------GTCTGTCAACC-- CCTGAACG--TGCCC--  
 82 AE000940_Methanobacterium_ther                      14.2%  --GGGCTAGACC--GGAGGGTTAGGGG-TCCTCTGTAAGCGC--A--A-A TCCC-CTATAT--GGCGC--GGTT-G------------------AAGTTC -GG-G---GG--ACGGCTGAt--------------TGACTGTCCA--T-C G---GCCCTGATGGTCGGTGT---CG------A-AGCCTCGTCC-C-GCA GGAT-C-AGTG----GTGATG-G-------GGCCCTG--ACTGGAGGG-- T---------CAG-GGTAAACCATC-T----TA-G----TCA-TGGGAAC --GGGTCAGGCCTGGA--AAGGAGCAGCCCTA-CC-ATG--G-ACA--GC -T-GATGCTTGC--GGATT-AACG-GGGTGGAGCCG--GT--CATCAGG- A-T--CA-C-CGGCGGAT-G-GA--AG----------ATCTGTCAACC-- CCTGAACG--TGCCC--  
 83 MJU67510_Methanococcus_jannasc                      12.0%  --TGGCTAGGCC--GGGGGGTTGGGCG-TCCCCTGTAACCCG--A--A-A TCGC-CCTTAT--GCGGG--GGCC-G------------------AAAACT -TG-G---GG--GCGGCATGt--------------CCTCCAGTCCTTC-- ---CTTCCCAGA-CTCCTCGA---TG------A-GGTCTCGTCC-C-GTG GGGCtC-GGCG----GTGGGG-G-------AGCATCT--CCTGTAGGG-- G---------AGA-TGT-AACCCCC-T----TT-A----CCT-GCCGAAC C-CCGCCAGGCCCGGA--AGGGAGCAACGGTA-GG-CAG--G-ACG--TC -G--GCGCTCAC--GGGGG-TGCG-GGACGGAGAAG--GAA--TCTGGG- G-Gc-GAgG---GAGGACTG-GA--GG----------ACATGCCCACC-- CCAAGGA---AGCCA--  
 84 MV7S_Mvoltae_7S_ribosomal_RNA_                      12.7%  --TGGCTAGGCT--GGGAGGTTAGGCG-TCTCCTGTAACTTG--A--A-A TCGC-CTT--T--GCGAG--AGCC-G------------------AAAACT -TG-G---GG--GCGGCATAa--------------GTTCCCAAATTTC-A ---TTCTTAAT--TAGTATGT---CG------A-CGTTTCGTCC-T-TTG GGGTaA-GATG----GTAAGA-G-------ACTCTCT--TTCTTAAGA-- A---------AGA-GTCAAACTCTT------TTCG----TAT-TTCGAAA C-CCGCCAGGCCCGGA--AGGGAGCAACGGTA-GA-ATT---TACT--TC -G--ACGCTCAA--GGGGT-AGCG-GGGCTGAGTAC--TA----ATTAA- G-Gc-AA-AaTGAGATTT-G-GT--GC----------TTTTGTCCACC-- CCAAGGA---AGCCA--  
 85 MA7SRNA_Macetivorans_7S_RNA_ge                      13.3%  --GAGCTAGTCC--GGGTAGCCCGGCG-TTACCTGTAACCCG--A--A-A TCGC-CGATAT--GCGGG--GGAC-G------------------AA-GCC -AA-T---GG--AAGA-------------------TGCGTCAAAGGGA-T TccAGCCTGTGATCTCAACTG---AG------A-AACCCCGTCC-T-GCT TGGA-T-G-AT----GCAGGT-A-----TGTGGACTT--GCTGGAAAA-- C---------AGG-TCCTCATACCC-T----AA------CTG-CGGAAAC C-GGTCGAGGCCCGGA--AGGGAGCAGACTCA-CT-GTG--G-GCA--AC -C-GTCGCTTGC--GGGGT-CGCG-GGGTGGAGAAG--AG--ATTCCAG- T-Ct-AC-TgAAATCTCC-C-AG--AT------------ACAACGACC-- TGCGGTG---TGCTC--  
 86 CNSPAX01_Pyrococcus_abyssi_com                      10.3%  --GGGCTAGGCC--GGGGGGTTCGGCG-TCCCCTGTAACCGG--A--A-A CCGC-CGATAT--GCCGG--GGCC-G------------------AAGCCC -GA-G---GG-GCGGTTCCC---G-A---------AGCCGCCTCCGG--A A---GCCAGGGC-CGAAC-GA---TG------A-GTCCTCGTCC-C-GCG GGGT-G-CCCG----GTGGGG-G-------AGGCACG--GCTGAAGGG-- C---------CGT-GCT-AACCCCC-T----TTAG-----GC-CCCAAAC C-CCGCAAGGCCCGGA--AGGGAGCAGCGGTA-GG-GGC---CACG--GA -G-CACGCTCGC--GGGGG-TGCG-GGGATGAG-GT--AG---GCCCTG- G-T--G----AAAGGAGG-C-GG--TG------G--AGGGTTCCCACC-- CTCGGGCG--TGCCC--  
 87 AP000001_Pyrococcus_horikoshii                      10.3%  --GGGCTAGGCC--GGGGGGTTCGGCG-TCCCCTGTAACCGG--A--A-A CCGC-CGATAT--GCCGG--GGCC-G------------------AAGCCC -GA-G---GG-GCGGTTCCC---G-A---------AGCCGCCTCTGG--A A---GCCAGGGC-CGAAC-GA---TG------A-GTCCTCGTCC-C-GCG GGGT-G-CCCG----GTGGGG-G-------AGGCACG--GCTGAAGGG-- C---------CGT-GCT-AACCCCC-T----TTGG-----GC-CCCAAAC C-CCGCAAGGCCCGGA--AGGGAGCAGCGGTA-GG-GGC---CACG--GA -G-CACGCTCGC--GGGGG-TGCG-GGGATGAG-GT--AG---GCCCTG- G-T--G----AAA-GGAGGC-GG--TG------G--AGGGTTCCCACC-- CTCGGGCG--TGCCC--  
 88 AL445063_Pyrococcus_furiosus_S                      10.6%  --GGGCTAGGCC--GGGGGGTTCGGCG-TCCCCTGTAACCGG--A--A-A CCGC-CGATAT--GCCGG--GGCC-G------------------AAGCCC -GG-G---GG-GCGGTTCCC---A-A---------AGCCGCTCCCAG--A A--GCCGAGGT--CGAAC-GA---TG------A-GTCCTCGTCC-C-GCG GGGT-G-CCCG----GTGGGG-G-------AGGCACG--GCTGAAGGG-- C---------CGT-GCT-AACCCCC-T----TTGG-----GC-CCCGAAC C-CCGCAAGGCCCGGA--AGGGAGCAGCGGTA-GG-GGC---CACG--GA -G-CACGCTCGC--GGGGG-TGCG-GGGATGAG-AT--AG----GCCTC- G-Gt-G----GATGGGAG-C-GG--TG------G--AGGGTTCCCACC-- CTCGGGCG--TGCCC--  
 89 AP000996_Thermoplasma_volcaniu                      14.6%  CCAGACTTGGCC-GGGGGGT-TAGGCG-TCCCCTGTA-CCCG--A--A-- --GT-CTAGAT--GCGGG--GGC--G-----------------ACAGCCC -GG-T---GA--GACCACCTg-----------------GGTTTCTGTC-A G--G-CCCCGT--GGAATCAT---TG------A-TCCTCTGTCC-C-TCT GGAT-C-GGAG-----GCCTG-C-----ATGTACATC--CTCAAAGGA-- G---------GGT-GTATGTGCAGCC-----TA------CCA-GGGGAAC --GCGCCAGGCCCGGA--AGGGAGCAACGACA-CC-CTG--G-ACT--CT -C-GATGCTGGA--GGGGT--GCG-GGGGTGAGAGG--AA----GCGGG- GgGt-AC-C-TGG------C-AG--G-----------ACGCCCAGACCga ACCGGGTGT--GTCTGG  
 90 TACID1_Thermoplasma_acidophilu                      14.5%  CCAGACTTGGCC-GGGGGGT-TAGGCG-TCCCCTGTA-CCCG--A--A-- --GT-CTAGAT--GCGGG--GGC--G-----------------ACAGCCC -GG-T---GA--GACCACCTg-----------------GGTTTCTGCC-A G--G-CCCTGC--GGAATCAA---TG------A-TCTCCTGTCC-C-TCT GGAT-C-G-GA----GGCCCAt------GGACACGAT--CTCAAAGGA-- G---------AAC-GCGCCCATGGC-T----TG------CCA-GGGGAAC --GCGCCAGGCCCGGA--AGGGAGCAACGACA-CC-CTG--G-ACT--CT -C-GATGCTGGA--GGGGT--GCG-GGGGTGAGAGG--AA----ACAGG- GgGt-AC-C-TGA------C-AG--G-----------ACGCCCAGACCga ACCGGGTGT--GTCTGG  
 91 TC7SRNA_Tceler_7S_RNA_gene                          12.4%  --GGGCTAGGCC--GGGGGGTTCGGCG-TCCCCTGTAACCGG--A--A-A CCGT-CGATAC--GCCGG--GGCC-G------------------AAGCCC -GG-G---GG-GCGGTTCCC---G-A---------AGCCGTTCCCGG--A A---GCCGGGG--CACAACGG---TG------A-TCCCTCGTCC-C-ACG GGGC-C-GGCG----GTGGGC-G-------GGGTCCG--GCTGGAGGG-- C---------CGG-GCT-AACGCCC-T----TT-G----CCC-GCCGAAC C-CCGTCAGGCCCGGA--AGGGAGCAGCGGTA-GG-CGG--G-ACG--TT -C-GGCGCTCGT--GGGGT-AGCG-GGGGTGAG-CG--AG----CCCCG- G-T--G----GAAGGGGA-C-GG--TG------G--AGGGTCCCCACC-- CCCGGGCG--CGCCC--  
 92 Candida_Albicans                                    16.4%  --------------GG----------------CTGTGA------------ -------T---G--------------------------------GCTTTT -AG-C---GG-AAGCG------------TG-----CTGCTCGTGTACC-T G--CTGTTTGTTGAAAATTTA--AGA------G-CAAAGTGTCCGG-CTC GATCcC-TGCGAAT--TGAATt------CTGAACGCT--AGAGTAATC-- AG--------TGT-CTTTCAAGTTCTG-G-TAATG---TTTA-GCATAAC C-ACTGGAGGGAAGCA--ATTCAGCACAGTAA-TG-CTAat-CGTG--GT -G--GAGGCGAAtcCGGAT-GGCA-CCTTGTTT-GT--TG----ATAAA- T----AG-T---GC-----G-GT--AT---CTAG-----TGTTGCAAC-- TCTAT------------  
 93 Neurospora_crassa_sequence_contig_157_(superconti   14.0%  -----------C--GA----------------CTGTAA------------ -------T---G--------GTC----------------------AAGGT -GG-G---TTtGAAGGCACTtga------------TTTTCTCAATGTC-T ---CTATTCCATGTCCAA-AT--CTGgaagccC-AGCGGCGCCCAG-CAC GAAC-CtTGCG----GTGGTC-Ac----CCACTCGCA--CGGGTAGCC-- TGcgacttgcTGC-GCG---TGGCC-C----TAAGcaa-TGA-AGATGAC --ACTTGAGAGAGGTTCCACTCTGCAGAGACA-TC-TTC---ACCG--TC -A-GGTGGCGCGc-TGGAT-TACGaTCGCTGGG-GG--GT----TGGGA- T-Ag-AG-C---G-TTGA-G-AT--GG----------AGATGTCGACT-- CCTATTTT---------  
 94 SPAC2C4_Spombe_chromosome_I_cosmid_c2C4             13.7%  -----------C--G-----------------CTGTAA------------ -------T---G--------GCT--------------------------T -GG-T---CG--AAGTGTTT-----AGTACTC------CCAATAGTG--- ------CATGTTCGGTGGTCT---CGggttc-G-AGTCTCGCTT-T-CGA TCCC-T-C-GA--T--CTGCC-Acg---TCTGTTCGA--AGAGTAGTC-- T---------TCGtGGCAACTGGCAGTt---AA-A----CCGTGTAGTAC C-GATGGAGGTTGGAA--ACAATGCACATCAC-TA-CCG--G-GTC--TT -G-GGCAGTGCG--ATAGC-GATG-GGATTCAC-CT--TC----GCAGG- -----------ATGTGCATG-GA--AG--TATAAA-CACAACGG-TCG-- -----------------  
 95 YLSCR2_Ylipolytica_DNA_for_7S_RNA_gene_SCR2         19.5%  -------------AG-----------------CTGTAA------------ -------T---G--------GCA---TTTTGTCGGAGTGGTA--AATCGC -CT-T---CT-TGTTG-------------------TGCGTTCGAGTTC-T G--GACTCTGCACTGGGCTAC--TTT------G-T---TTGTCCTT-TCC GAAT-T-CTGCGGT--TGATG-G-----GCGTCTCGGtcTGAGTAATC-- GGct------TTG-AGATTTCCGTT-C-T--AAGA---TTAA-CTGGGAT --ACTTCAGTGGAGCA--ATCCAGCAGAGATC-CA-GTT--GCCGT--GG -G-TATGGCGGT--GGGAT-AGCA-ACAAAGTGGTA--TA--TGTTATG- G----AA-G---GT-----A-TT--TG---------------CA-ATC-- ACGAC-----T------  
 96 YLSRP_Yeast_(Ylipolytica)_small_ribonucleoprotein   19.6%  -------------AG-----------------CTGTAA------------ -------T---G--------GCA---TTTTGTCGGAGTGGTA--AATCGT -CT-T---CT-TGTTG-------------------TGCGTTCGAGTCT-T G--GGCTCTGCACTTGGCC------A------T-TTGGTTGTCCTT-TCC GAAT-T-CTGCGGT--TGATG-G-----GCGTCTCGGtcTGAGTAATC-- GGct------TTG-AGATTTCCGTT-C-T--AAGA---TTAA-CTGGGAA --ACTTCAGTGGAGCA--ATCCAGCAGAGATC-CA-GTT--GCCGT--GG -G-TATGGCGGT--GGGAT-CGCA-ACCAA--G-TG--GT----ATATG- T----TA-T-GGAA-----G-AT--AT------------TTACG-ATC-- ACGAT-----T------  
 97 TT7SL_Tetrahymena_Thermophila_gene_for_7S           16.1%  ---------GCC-AGGGTAGC------AATACCTGTGT------------ -----CTATATG-----T--GGC--A-----------------TAAACAA -TG-T---AG-GTTGTGATA---G-ATAGGAT----A---TGAGAGTT-T ---GATGAGACAGTTTGCT------A------A-GAGTGTGCCCGC-TCC AAAC-A-A-TGAGT--TGCTAt------GGTGGTAAC--CTAGTAATA-- G---------GAC-TCCACCAGGGCAT-T--AAAG----AGCTAAGGAAA C-GCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACT-TGC---CGCT--TG -T-TGTGGTGGA--AGGAT-AACA-TACTC--A-TT--AA----CTGTC- A----AA-C-TAAT----c-------G--TTCTA--C-TATCAAAGCCag ACATT------------  
 98 Tetrahymena_Rostrata                                15.4%  ---------GCC-AGGGTAGC------AATGCCTGTGACCTC-------- --------------GTGT--GGC--A-----------------TAAACAA -TG-TagtTA-GAATAGTCAg--------------AGTATGA-GAGTT-T ---GATGAGACAGTTTGCT------A------A-GAGTGTGCCCGT-TCC AAAC-A-G-TGAGT--TGCTAt------GGTGGAAAC--CTAGTAATA-- G---------GAC-TTCACCAGGGCAT-T--AAAG----AGCTGAGGAAC C-GCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACT-TGC---CGCT--TA -T-TGTGGTGGA--AGGAT-AACA-TACTC--A-TT--AA--CTGTCAA- G-Ct-AA-T-CGGT-TCTGC-TA--TT----------CTGATCAGACA-- -----CT----------  
 99 AF047723_Trypanosoma_Brucei_rh                      13.0%  ---------GCC--GGAGCGC--A---TTGCTCTGTAACCTT-------- --------------CGGG--GGC--------------------TGATCCC -GC-T---TA-GCGGG-GACg--------------TCTTGGACAAGCG-G G--GGTTCTGT-----TGCGT---TG------A-CTTGGTGTTC-T-GCT TGGT-T-G-CGTGT--CGGTG-Tt----GAGGTCGCC--ACTGTAGAG-- A---------GGC-GTTCTCGCGCCGT-T--AAAG----TGG-GGGGAAC --GGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCCAC-CT-TGC----GCA--CG -T-TCCCGTTGC--AGAAG-CACA-CCGAGGAGCAT--C-----TCAGG- A-Ct-T------TGCGCCCC-AA--GT----------GTCGTCGCG-A-- GGCGG---T--------  
100 TRB7SLRNA_Trypanosoma_Brucei_7SL_RNA_gene           13.0%  ---------GCC--GGAGCGC--A---TTGCTCTGTAACCTT-------- --------------CGGG--GGC--------------------TGATCCC -GC-T---TA-GCGGG-GACg--------------TCTTGGACAAGCG-G G--GGTTCTGT-----TGCGT---TG------A-CTTGGTGTTC-T-GCT TGGT-T-G-CGTGT--CGGTG-Tt----GAGGTCGCC--ACTGTAGAG-- A---------GGC-GTTCTCGCGCCGT-T--AAAG----TGG-GGGGAAC --GGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCCAC-CT-TGC----GCA--CG -T-TCCCGTTCG--AGAAG-CACA-CCGAGGAGCAT--C-----TCAGG- A-Ct-T------TGCGCCCC-AA--GT----------GTCGTCGCG-A-- GGCGG---T--------  
101 AF006750_Leptomonas_collosoma_                      12.0%  ---------GCC--GGAGCC-------TTGCTCTGTAACCTT-------- --------------CGGG--GGC--T-----------------TTCACCA -GC-T---GA-ACAGGGAGCt------GTCTG---GA--CCAGCATA--G G---GTGCTTGC----GGCGT---TG------A-CGTGGTGCTC-T-GCT TGGC-T-G-TGTGT--CGGAG-GcctccGGGTGCCCC--CTTGCAGAA-- G---------GGGcGCGCCCCCTCCGT-T--AAAG----TAG--AGGAAC T-GGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCAC-CT--CG---CGCA--CG tC-TGCCGTTGC--AGAAC-CACA-CCGCGGAG-CC--T----GTCATC- A-C--C----TGC-GCCC-C-AGg----CGAT------CCTGTGAAGC-- ------TTT--------  
102 LMFL1232_Leishmania_major_Frie                      14.0%  ---------GCC--GGAGCT-------CTGCTCTGTAACCTT-------- --------------CGGG--GGCTaA-----------------CCAGGCT -TA-G---CGgGGAGGACGTg-----------------------GACC-A G--CGAGGGTGA-TTTGCTGCg-TTG------A-CGTGGTGCTC-T-GCT TGGC-T-G-TGTGT--CGGTGtG-----GCTTGCCCC--CCTGCAGAG-- GG--------TGGcGCGGGTCCGCCGT-T--GAAG-----CG-AGGGAAC C-GGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCC-ACG---CACG--TC -C--GCCGTTGC--AGAAT-CACA-CCGCGGAG-CA--TG---TCCGCA- C-Tt-GA-G-CCCC-----------------------ACGCTTCGTCG-- CGAAGCCTT--------  
103 AF095839_Entosiphon_sulcatum_t                      13.2%  ---------GCCt-GGAGGGTGTCACGCCCCTCTGTCACCTG-------- -------A---G--TTGGgaGGC--A----------------c--TGTGT -GC-C---TG-GGACTGCCCc--A-CACACCCtagGCCTCCCTTGGCC-T G--STTGCACCATGGTGCCATg-CAG------A-GACTGCGCCCAC-TGA AAGA-C-AGCT-GC--CCTCA-C-----TGGCACCGC--CTGGCAACAtt G---------GCG-GTGTCTTGGAGGC-TaTGATG----CGG-AGGGGAC T-GGGCAAGGCTGGCA--ACAGAGCAGCCAAAACC-TCC---CACA--GC -T-GTCAGTTCA--GGGAA-CACG-CAGTTGAG-TG--GT----GCTGC- A-Gc-AG-G---TTGGGCTG-AG--G----GTGCA---AGGTAGGACTg- GGCATACC---------  
104 Zea_MaizeA                                          12.6%  ----------CC--GAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCG-------- -------A---G--CGGG--GGC--A-----------------TTAAGGT -GG-T---GT-GAATGCTTT---G-CGATGGC------TTTCTGGGCC-C T--GGGCTCGT--TGTGACAC--TGG------C-CGGCTTGCCCAT-CCC AAGT-T-G-GTAGT--GTCTG-Gt----GGGGGCTCT--AGCGAAAGC-- TT--------TGG-GTCTCTGCAGACC-T--GGAG----CGG-CAGGAAT G-GCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCC---GACT--CC -C-AACGGTGGG--AGGAT-AACGaAGCCGCTG-CA--CT----TTGAG- C-Ct-AA-C-TCAG-GCT-C-AG--AA---CCTCA-C-TAAGCAAACC-- ACCATCTTT--------  
105 Zea_MaizeB                                          12.7%  ----------CC--GAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCG-------- -------A---G--CGGG--GGC--A-----------------TTAAGGT -GG-C---GC-GGATGCTTT---G-CGATGGT-------TTCTGGGCC-T ---GGGCTCGT--TGTGACTC--TAG------C-CGGCTTGCCCAT-CCC AAGT-T-G-GTAGT--GTCTG-A-----CGGGGCTCT--AGCGAAAGC-- TT--------TGG-GTCTCTGCAGACC-T--ACAG----CGG-CAGGAAT G-GCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCC---CACT--TC -C-AACGGTGGG--AGGAT-AACA-AGCCGCTG-CA--CT----TTGAG- C-Cc-AA-C-ACAG-ACC-C-AG--AT---CCTCT-C-TTAGCAAACC-- ACCATCTTT--------  
106 Zea_MaizeC                                          11.7%  ----------CC--GAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCG-------- -------A---G--CGGG--GGC--A-----------------TTAAGGT -GG-T---GT-GGATGCTTG-----GTACCGT-------GTCTTTGCC-T G---GGTTCATGGTGTGCCTT---TG------T-TGGCCTGCCCGT-TCC AAGT-T-G-GTAGT--GGCCG-Tt----GGAAGCTTG--GGCGTAGGC-- CC--------TGG-GCTTCCTTGGACC-T--ATAG----TGG-CAGGAAC G-GCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCC---GGCT--AT -T-AACGGTGGA--AGGAT-AACA-GGCCACTG-CA--GC----ATGGG- C-T--CG-C-TTA-AGGC-CtAG--AC---TTCATaCTAAAGCAGACC-- ACCATTTTT--------  
107 Zea_MaizeD                                          12.3%  ----------CC--GAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCG-------- -------A---G--CGGG--GGC--A-----------------TTAAGGT -GG-T---GC-GGATTCTTT---G-CGATGGC------TTTCTGGGCC-C ---GGGCTCGCTATGTGCCTT--TGG------C-CGGCCTGCCCGT-CCC AAGT-T-G-GTAGT--GGCTG-Gc----GGAGGCTTT--AGCGGAAGC-- T---------TTG-GTCTCTCCAGACC-T--GAAG----TGG-CAGGAAT G-GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCC---CGCT--TC -C-AACGGTGGG--AGGAT-AACA-GGCCGCTG-CA--CT----TCGAG- C-Cc-AA-C-TCAG-GCC-C-AG--AG---CCTCA-C-TAAGCAGACC-- ACCATCTT---------  
108 Zea_MaizeE                                          12.6%  ----------CC--GAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCG-------- -------A---G--CGGG--GGC--A-----------------TTAAGGT -GG-T---GC-GGATTCTTT---G-CGATGGC------TTTCTGGGCC-C ---GGGCTCGCTATGTGCCTT--TGG------C-CGGCCTGCCCGT-CCC AAGT-T-G-GTAGT--GGCTG-Gc----GGAGGCTTT--AGCGGAAGC-- T---------TTG-GTCTCTCCAGACC-T--GAAG----TGG-CAGGAAT G-GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCC---GGCT--TC -C-AACGGTGGG--AGGAT-AACG-GGCCGCTG-CA--CT----TCGAG- C-Cc-AA-C-TCAG-GCC-C-AG--AG---CCTCA-C-TAAGCAGACC-- ACCATCTTT--------  
109 Zea_MaizeF                                          11.8%  ----------CC--GAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTA-------- -------A---G--CGGG--GGC--A-----------------TTAAGGT -GG-T---GT-GGATGTTTC---C-TGACGGA-------TTCTGGGCC-T ---GGGCTTGTA-TGTGCCAC--TGG------C-CGGCCTGCCCGT-TCC AAGT-T-G-GTTGT--GGCTG-G-----TGGGGCTCG--GGCGAAGGC-- C---------TGG-GCCTCTTTAGACC-T--GAAG----CGG-CAGGCAT G-GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCC---CGCT--TC -C-AACGGTGGG--AGGAT-AACA-GGCCGCTG-CA--TT----GCAAG- C-Cc-AA-C---TCGGTC-C-AG--AG---CCTCA-T-TAAACAGACC-- ACCATCTTT--------  
110 Zea_MaizeG                                          12.6%  ----------CC--GAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCG-------- -------A---G--CGGG--GGC--A-----------------TTAAGGT -GG-T---GC-GGATTCTTT---G-CGATGGC------TTTCTGGGCC-C ---GGGCTCGCTATGTGCCTT--TGG------C-CGGCCTGCCCGT-CCC AAGT-T-G-GTAGT--GGCTG-Gc----GGAGGCTTT--AGCGGAAGC-- T---------TTG-GTCTCTCCAGACC-T--GAAG----TGG-CAGGAAT G-GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCC---CGCT--TC -C-AACGGTGGG--AGGAT-AACG-GGCCGCTG-CA--CT----TCGAG- C-Cc-AA-C-TCAG-GCC-C-AG--AG---CCTCA-C-TAAGCAGACC-- ACCATCTTT--------  
111 AP003253_OSativa_chr_1__PAC_cl                      12.9%  ---------GCC--GAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCA-------- -------A---G--CGGG--GGC--A----------------cTAAAGGT -GGcT---GC-GGATGTTTG-----GTGTGGA-------TTCTGATCC-T G--GGCCCCATGTTGTTGTAAtcTTG------C-TGGCTTGCCCGT-TCC AAGT-T-GCGTAGTg-GGCCG-G-----AGGGGCTTT--GGCGAAGGC-- CTttgc----TTT-GCTTCTCCGGCCC-T--AAAG----TGG-CAGGCAC A-GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCC---CGCT--TC -C-ATCGGTGGA--AGGAT-AACA-GGCTGCTG-CA--CC----TTGGG- C-Cc-GC-T-TCTG-GCC-C-AG--AG---TCCCT-CTACAACAGACC-- ACCATCTTT--------  
112 AP003333_OSativa_chr_1__BAC_cl                      12.9%  ---------GCC--GAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCA-------- -------A---G--CGGG--GGC--A----------------cTAAAGGT -GGcT---GC-GGATGTTTG-----GTGTGGA-------TTCTGATCC-T G--GGCCCCATGTTGTTGTAAtcTTG------C-TGGCTTGCCCGT-TCC AAGT-T-GCGTAGTg-GGCCG-G-----AGGGGCTTT--GGCGAAGGC-- CTttgc----TTT-GCTTCTCCGGCCC-T--AAAG----TGG-CAGGCAC A-GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCC---CGCT--TC -C-ATCGGTGGA--AGGAT-AACA-GGCTGCTG-CA--CC----TTGGG- C-Cc-GC-T-TCTG-GCC-C-AG--AG---TCCCT-CTACAACAGACC-- ACCATCTTT--------  
113 AP003523_OSativa_chr_6__PAC_cl                      12.7%  ---------GCC--GAGCTCAGCAGCGCGAGCTTGTAACCCG-------- -------A---G--CGGG--GGC--A-----------------TTAAGGT -GG-T---GT-GGACGTTGC---G-GTACGGC-------TGC-GGGCC-T G---GGTCGGC--ATTGCTAC---AG------A-TGGCTCGCCCGT-TCC AAGT-T-GAGTAGT--GGGCC-Gg----CGGGGCTTG--TGCGAAAGC-- TCt-------GGG-GCCCCACGGTTCC-T--AGAG----TGG-CAGGCAT G-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAATACT-GCC---CGCT--TC -C-AACGGTGGA--AGGAT-AACG-GGCCGCCG-CA--CT----GCTGG- C-C--CG-CtTGGG-TCT-C-GC--AT---CCTAC-T-CCAACGGACC-- ACCACTTTT--------  
114 AC079888_1_OSativa_chr_10_clon                      11.5%  ---------GCC--GAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCG-------- -------A---G--CGGG--GGC--A-----------------ATAAGGT -GG-T---GTtGGATGCCTG-----GTCGTTT---GC-GCTTGGGGTC-T G--CGCCTGTG--GTTTGCAC--TAT------G-CGGCCCGCCCGT-TCC AAGT-T-GCGTAGC--GTGTGtG-----GGGCGCCTG--GGCGAAGGC-- T---------CGA-GCGTCCCTGCACC-T--AGAG----TGG-CGGGTAT T-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACC-GCC---CGCT--TC -C-AACGGTGGA--AGGAT-AACG-GGCCGCTG-CA--GC----CCTGG- C-Cc-GC-T---TCCGGCCC-AAg----TGCCTTC-C-ATGGCAGACC-- ACCACCTTT--------  
115 AC079888_2_OSativa_chr_10_clon                      11.6%  ---------GCC--GAGCCAAGTAGCGATGGCTTGTCACCCG-------- -------A---G--CGGG--GGC--A-----------------ATAAGGT -GG-T---GC-GGATGCCTG-----GTCGTTT---GC--GCTTTGGCC-T G--GGCCTGTG--GTTCGCTC--TAT------G-CGGCCCGCCCGT-TCC AAGT-T-GCGTAGC--GTGTAtG-----GGGCGCCCT--GGCGAAAGC-- T---------AGA-GCGTCCCTGCACC-T--AGAG----TGG-CGGGTAT T-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACC-GCC---CGCT--TC -C-AACGGTGGA--AGGAT-AACG-GGCCGCTG-CA--GC----CCTGG- C-Cc-GC-T---TCCGGCCC-ATg----TGCCTTC-C-ATGGCAGACC-- CCCATCTTT--------  
116 TASRP7S1_Wheat_signal_recognit                      13.8%  ----------CC--GAGCTAGTTGCGA-GAGCTTGTAACCCG-------- -------A---G--TGGG--GGC--A-----------------TTAAAGT -GA-T---GT-GAACNCTGTt-----GTAGCG------CTGC-GGGCC-T ---GGTCTGGG--TGTGCTAC---TG------C-TGGCCCGCCCGT-TCC AAGT-T-GCGTAGT--GGACC-Gcc---TGGGGCTTA--TGCGAAAGC-- ----------TGG-GTCTCACGGTCCA-T--AATG----TGG-CAGGCAC A-GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC---CGCT--TC -C-AACGGTGGA--AGGAT-AATG-GGCCGCTG-CA--CT----CCTAGg A-Cc-AA-T-TGGG-CCT-C-GC--AG--CCTAC---TCCAGCAGACC-- ACCATCTTT--------  
117 TASRP7S2_Wheat_signal_recognit                      12.5%  ----------CC--GAGCTAGTTGCGG-GAGCTTGTCACCCA-------- -------T---G--TGGG--GGC--A-----------------TTGAGGC -GG-T---GT-GGATGCTTG-----GTGCGGT-------TTGTTGGCC-T G---GGCTTGT--GATGTAACc-TTG------C-TGGCCTGCCCGT-TCC AAGT-T-G-GTAGT--GGGCT-G-----GGTGGCTGG--GGCGAAAGC-- T---------TCG-CCTTCTCAGGCCT-T--AAG-----TGG-CAGGCAC C-ACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC---CGCT--TC -C-AACGGTGGA--AGGAT-AACA-GGCCGCTG-CA--GC----ATGGG- C-C--CG-C-TCTGGGCCTC-CT--AC---CCCGC-C-ATAGCAGACC-- ACCATCTTT--------  
118 AThaliana_chr1_1                                    14.9%  ---------GTC--GAACCTAGTAACGTGGGTTTATGATCCG-------- -------A---G--TGGA--GAC--A-----------------ACAAGGT -GA-T---GG--TACA-TTG---G-GTCGGAT------CTCAATGGGC-C G---GGTTCGGCTTGGGCTCT--TTA------C-TGGCCTGCCCAT-TCC AAGT-C-G-GGAGTt-GAGAT-A-------TCTTCTG--AGCGAAGGT-- T---------CGG-AGCCAATATCTCT-T-TAGAG----CGG-AGGAGAC C-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACC-TTC---CGTT--CT -C-GACGGTGGA--AGGAT-AACG-GGCCCGTTGTC--TT----CCGAG- C-C--CA-C-TATGACCC-A-TT--AG--GCCGAC-TCCAACTGAGCC-- ATCACTTT---------  
119 AThaliana_chr1_2                                    14.1%  ---------GTC--GAGCTCAGTAACGTGGGCTTGTGACCCG-------- -------T---G--TGGG--GAC--A-----------------ATAAGTT -GG-T---GG--AACA-CTG-----GCTCGGC-------CCA-CGGGT-C G---GATCTGTT-GTGGCATT--GTT------C-CGGGCTGCCCAG-TCC AAGC-T-G-AGAGT--GATCC-G-----TGTGTGTTA--AGCGAAGGC-- T---------TGG-CTCAGGCGGTTCT-T--GCAG----TGG-AGGGCAA T-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGATCACC-TCC---CGCT--CT -C-AGCAGTGGA--CGGAT-CACA-GCTCGACG-CC--AC----TCAGA- T-T--CA-C-CATG-GCCTG-CT--GG--CTCGTT-CCCAGCTGGACC-- ACCAATTT---------  
120 AThaliana_chr2_1                                    14.3%  ---------GTC--GAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCA-------- -------A---G--TGGA--GAC--A-----------------ATAAGGG -GA-T---GG--GACGTTGG-----GTCGATC-------TCATTGGGC-C G---GGTTCGGGTTGGGCTAT--ATT------C-TGGCCCGCCCAT-TCC AAGT-T-G-GGAGTt-GAGGC-A-----TGGGCTTCG--AGCGAAGGC-- T---------CGG-GTCTCATGTCTTC-T--AGAG----TGG-GGGAGAC C-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACC-TCC---CGCT--CT -T-GACGGTGGA--AGGAT-TACG-GGCCATTG-CC--TT----CCGAG- C-C--CA-C-TATGACCC-A-AT--AA--GCCGCT-C-CGATTGGACC-- ATCACTTT---------  
121 AThaliana_chr2_2                                    15.3%  ---------GTC--GAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCG-------- -------A---G--TGGG--GAC--A-----------------ATAAGGT -GG-T---GG--AACA-GTG-----GTTCAAT-------TCCTCGGGT-C G---GACCTGATGCTGACATA--TAT------C-TGAGCTGCCCAG-TCC AAGC-T-G-TGAGT--AATCT-G-----TGTGGGTCA--GGCGAAGGC-- T---------TGA-CTCAGGCGGATTC-T--AAAG---TCGG-AGGGTAA T-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACT-TCC---CTCT--TA -C-AGCAGTGGA--TGGAT-CATA-GTTCGAAG-TC--TC----TCAGA- T-C--CA-C-TATGGCCC-G-CT--GG--TTCGAT-CTCTCCTGGACC-- ACCACTTT---------  
122 AThaliana_chr4_1                                    14.7%  ---------GTC--GAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCA-------- -------T---G--TGGG--GAC--A-----------------TTTAGAT -GG-T---GG--AACA-CTG-----GTTCGGG-------TCCACGGGC-C G---GTTCTGTTGTTGGCATG--TTT------C-TGGGCTGCCCAG-TCC AAGC-T-G-TGAGT--AAGAC-G-----TGTGTGTCA--AGCGAAGGC-- T---------TGG-CTCAAACGGCTTC-T--AAAG---TTGG-AGGGTAA T-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACT-TCC---CGCT--TA -C-AGCAGTGGA--CGGAT-CACA-GTTTAGCG-TC--GC----TCAGA- A-C--CA-C-TATGGCCT-G-CT--GG--TCCGAT-CTCATATGAACC-- ACCATTTT---------  
123 AThaliana_chr4_2                                    14.3%  ---------GTC--GAGCGAAGTAACATGAGCTTGTAACCCA-------- -------T---G--TGGG--GAC--A-----------------TTAAGAT -GG-T---GG--AACA-CTG-----GTTCGGG-------TCCACGGGC-C G---GTTCTGTTGCTGGCATG--TTT------C-TGGGCTGCCCAG-TCC AAGC-T-G-TGAGT--AAGAC-G-----TGTGTGTCA--AGCGAAGGC-- T---------TGG-CTCAAACGGCTGC-T--AAAG---TTGG-AGGGCAA T-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGATTACT-TCC---CGCT--TA -C-AGCAGTGGA--CGGAT-CACA-GTTTGGCG-TC--GC----TCAGA- A-C--CA-C-TATGGCCT-G-CT--GG--TCCGAT-CTCATCTGAACC-- ACCATTTT---------  
124 AThaliana_chr4_3                                    14.9%  ---------GTC--GAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA-------- -------T---G--TGGG--GAC--A-----------------TTAAGAT -GG-T---GG--GACA-CTG-----GTTCGGT-------TCCTCGGAT-C G---GTTCTGATGTGGGCATG--TTT------C-TGAGCTGCCCAG-TCC AAGC-T-G-TGAGT--AATTA-Gt----GTTGAGTTG--AGCGAAGGC-- T---------TGG-CTCATGCAGGTTC-T--AGAG---TCGG-AGGGTAA T-GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACT-TCC---CGCT--TA -C-AGCAGTGGA--CGGAT-CACG-GTTTAGCG-TC--GC----TCAGA- A-C--CA-C-TATGGCCT-G-CT--GG--TCCGAT-CTCATATGAACC-- ACCATTTT---------  
125 AThaliana_chr5_2                                    14.7%  ---------GTC--GAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCA-------- -------A---G--TGGG--GAC--T-----------------ATAAGAT -GG-T---GG--AACA-CTG---G-ATCGG---------CCCACGGGT-C G---GATTTGTTGTTGGCATA--GGT------C-TGGACTGCCCAA-TCC AAGC-T-G-TGAGT--GAACC-G-----TATGAACCA--AGCGAAGGT-- T---------TGA-TCCGTACGGTTGC-T-AAAGG----TTG-AGGGTAT T-GCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACC-TCC---CGCT--CT -C-AGCAGTGGA--CGGAC-AACG-GTTCGACG-CC--AC----ACAAA- T-C--CA-C-TATGGTCCGC-TG--GC---TCGTAaCCCGCTTGAACC-- ACCATTTT---------  
126 HLU236703_Humulus_lupulus_HL7S                      15.6%  ---------GCC--GGGCTCAGCAACGTGGGCCTGTAACCCA-------- -------A---G--TGGG--GGC--A-----------------TGAGGGA -AA-T---GA--GACT-TTG-----GGCCGAC-------CCGAGAGAT-C G---GATTCAGTGTCGGCTGA--TTA------C-TGGTTCGCCCGT-TCC AAGC-A-A-AGAGCt-GGGCT-G-----GGTGAGTTG--GACGAAGGT-- C---------TGG-CTTACTCAGCTCC-T--AAAG----CGG-TGGGTAA C-GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACC-TCC---CGTT--CT -T-GGCAGTGGA--AGGAC-AACG-AGCCGGTG-CT--GC----CTGGG- C-T--CA-C-CATGGTTCAC-TT--GG---CTGAT-CCTAATTGGACC-- ATTTCTTTT--------  
127 HLU236704_Humulus_lupulus_Hl7S                      15.5%  ---------GCT--GGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCA-------- -------A---G--TGGG--GGC--A-----------------TGTGGGA -AA-T---GG--AACT-TTG-----GGTCAGC-------CCAGTGGAT-C G---GGTCCAGAGTTAGCTGT--TTA------C-TGGTCTGCCCAT-TCC AAGC-C-G-GGAGTt-GGGCT-G-----AGTGATTTG--GGCGAAGGC-- C---------TGG-GTTGCGCAGCTCC-T--AGAG----TGG-AGGGTAA T-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACC-TCT---CGCT--CT -C-GGCAGTGGA--AGGAT-AACG-GGCCGGTG-CT--TC----CTGGA- T-C--CA-A-CATGGTTCAC-TG--GG--CTGACT-CTTAATAGGACC-- ATTTCTTTT--------  
128 HLU236705_Humulus_lupulus_Hl7S                      15.6%  ---------GCC--GGGCTCAGCAACGTGGGCCTGTAACCCA-------- -------A---G--TGGG--GGC--A-----------------TGAGGGA -AA-T---GA--GACT-TTG-----GGCCAGC-------CCAGAGAGT-C G---GATTCAGTGTCGGCTGA--TTA------C-TGGTTCGCCCGT-TCC AAGC-A-A-AGAGCt-GGGCT-G-----GGTGAGTTG--GACGAAGGT-- C---------TGG-CTTACTCAGCTCC-T--AAAG----CGG-TGGGTAA C-GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACC-TCC---CGTT--CT -T-GGCAGTGGA--AGGAC-AACG-AGCCGGTG-CT--GC----CTGGG- C-T--CA-C-CATGGTTCAC-TT--GG---CTGAT-CCTAATTGGACC-- ATTTCTTTT--------  
129 HLU236706_Humulus_lupulus_Hl7S                      15.2%  ---------GCC--GGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCA-------- -------A---G--TGGG--GGC--A-----------------TGTGGGA -AT-T---GG--GACT-TTG-----GGTCAAC-------CCAGTGGAT-C G---GGTCCAGTGCTAGCTGC--TTA------C-TGGTCTGCCCAT-TCC AAGC-C-G-GGAGTt-GGGCT-G-----AGTGACCTG--GGCGAAGGC-- C---------TGG-GTTGCGCAGCTCC-T--AGAG----TGG-AGGGCAA T-GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACC-TCC---CGCT--CT -C-GGCAGTGGA--AGGAT-AACG-GGCCGGTG-CT--AC----CTGGA- T-C--CA-C-CATGCTTCAC-TG--GG--CTGACT-CTTAATAGGACC-- ATTTCTTTT--------  
130 Lycopersicon_EsculentumA                            15.8%  ---------GGC--GAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCA-------- -------A---G--TGGA--GAC--A-----------------TCAAAGT -GG-T---TG--AATA-TTG-----GGCTTTA-------CCAGAAGGT-T G---GGCTTGG--TGGGCTTA--GTT------C-TGGCCTGCCC-TgTCC AAGC-A-C-AGAGTt-GGATC-T-----CGAGGCCCA--AATGAAAAT-- A---------TGG-GCTTCTTGATTCC-T--AAAG----TGG-GGCGGAC C-GCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GC-TCC---CGCT--CT -G-TGCAGTGGA--AGGAT-AATG-GGTCGGTG-TC--TTA---TCAAG- T-T--CA-G-TAA-CGCCTA-AT--GG--GTTGCT-C-CAATAA-ACA-- ACCACCTTT--------  
131 Lycopersicon_EsculentumB                            15.7%  ---------GTC--GAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCA-------- -------A---A--TGGG--GGC--A-----------------TTAATGT -GG-T---GG--AATG-TTG-----GGCTGTA-------CCAGATGGT-T G---GGCTTGG--TGGGCTAA--TTT------C-TGACTTGCCC-TaTCC AAGC-T-T-AGAGTt-GGATC-A-----TGTGGCCCA--ATTGAAGAA-- A---------TGG-ACTACTTGATTCG-T--AAAG----TGG-GGCGGAA T-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTC---CGCT--CT -A-AGCGGTGGA--AGGAT-AACG-AGTCGGTG-TT--CT----CTGAG- T-C--CA-G-TAA-TGCCTG-AT--GG--GCTGCT-C-TAATTAAACC-- ACCACTTTT--------  
132 Lycopersicon_EsculentumC                            13.7%  ---------GCC--GAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCA-------- -------A---G--TGAG--GGC--A-----------------TCAGTGT -GG-T---GG--AATG-TTG-----AACATGC-------CCAGAAGGT-A ---GGGCTTGT--GTGACAAT--TCT------C-TGGCCTGCCC-TgTCC AAGC-A-A-AGAGTt-GGGTC-T-----TGTGGGCCA--AGCGAAGGC-- T---------TGG-GCTGCTGGGCTCC-T--AAAG----TGG-GGTGGAC T-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGC-TCC---CGCT--CT -G-TGCAGTGGA--AGGAT-AACG-AGCCAGTG-TC--AT----ATAAG- T-Tc-AA-C-GAA-TGTCTG-AT--GG--GCTGTT-C-TAGTTAAACT-- ACCACATTT--------  
133 Lycopersicon_EsculentumE                            13.7%  ---------GTC--GAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCA-------- -------A---G--TGGG--GAT--G-----------------TTAAGGT -GG-T---GG--AATA-TTG-----GGCTGTC-------CCAGATGGC-T G---GGCTTGG--TGGGCTAA--TTT------C-TGGCCTGCCC-TaTCC AAGT-A-C-AGAGTt-GGATC-A-----TGTGGTCCA--ATTGAAAGA-- A---------TGG-GCTACTAGATTCC-T--AAAG----TGG-GGTGGAC --CCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAAC-TTC---CGCT--TT -G-TGCAGTGGA--AGGAT-AACG-GACCGGTG-CC--TT----CCAAG- T-Tc-CA-T-TAA-TGCCTG-AT--GG--GCTGTT-C-TAGTTAAACT-- ACCACATTT--------  
134 Lycopersicon_EsculentumF                            13.4%  ---------GCC--GAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCG-------- -------A---G--TGGG--GGC--A-----------------ACAATGT -GG-T---GG--AATG-TTGg-----GTCCAT-------CTTGATGGA-T ---GGGCTTGA--AGGGCTAAt-GTT------C-TGGCCTGCCC-TgTCC AAGC-A-C-AGAGTt-GGGTC-A-----AGTGGTCTA--TACGAAAGT-- A---------TAG--CCACTTGGCCTT-T--AGAG----TGG-GATGGAC T-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGT-CCC---CGCT--CT -G-TGCAGTGGA--AGGAT-CACG-GGCTAGTG-CT--CT----TTGAG- T-CctAA-C-AAA-AACCTG-AT--AG--GTTGC---CTAATTAAACC-- ATCACTTTT--------  
135 Lycopersicon_EsculentumG                            14.4%  ---------GCC--GAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCA-------- -------A---A--TGGG--GGC--A-----------------TTAATGT -GG-T---GG--AATG-TTG-----GGCTGTA-------CCAGATGGT-T G---GGCTTGG--TGGGCTAA--TTT------C-TGGCCTGCCC-TaTCC AAGC-A-C-AGAGTt-GGATC-A-----TGTGGTCCA--ATTGAAAGA-- A---------TGG-GCTACTAGATTCC-T--AAAG----TGG-GGTGGAC C-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAAC-TTC---CGCT--TT -G-TGCAGTGGA--AGGAT-AACG-GACCGGTG-CC--TT----CCAAG- T-Tc-CA-T-TAA-TGCCTG-AT--GG--GCTGCT-C-CAATTAAACC-- ACCACTTTT--------  
136 Lycopersicon_EsculentumH                            16.7%  ---------GTT--GAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCA-------- -------A---G--TGGA--GAC--A-----------------TCAAAGT -GG-T---TG--AATA-TTG-----GGCTGTA-------CCAGATGGT-T G---GGCTTGG--TGGGCTAA--TTT------C-TGACTTGCCC-TaTCC AAGC-T-T-AGAGTt-GGATC-A-----TGTGGCCCA--ATTGAAGAA-- A---------TGG-ACTACTTGATTCG-T--AAAG----TGG-GGCGGAA T-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGC-TCC---CGCT--CT -G-TGCAGTGGA--AGGAT-AATG-GGTCGGTG-TC--TTA---TCAAG- T-T--CA-G-TAA-CGCCTA-AT--GG--GTTGCT-C-CAATAA-ACA-- ACCACCTTT--------  
137 Lycopersicon_EsculentumI                            15.8%  ---------GCC--GAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCA-------- -------A---A--TGGG--GGC--A-----------------TTAATGT -GG-T---GG--AATG-TTG-----GGCTGTA-------CCAGATGGT-T G---GGCTTGG--TGGGCTAA--TTT------C-TGACTTGCCC-TaTCC AAGC-T-T-AGAGTt-GGATC-A-----TGTGGCCCA--ATTGAAGAA-- A---------TGG-ACTACTTGATTCG-T--AAAG----TGG-GGCGGAA T-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTC----GCT--CT -A-AGCGGTGGA--AGGAT-AACG-AGTCGGTG-TT--CT----CTGAG- T-C--CA-G-TAA-CGCCTG-AT--GG--GTTGCT-C-CAATTAAACC-- ACCATTTTT--------  
138 Lycopersicon_EsculentumJ                            15.7%  ---------GTC--GAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCA-------- -------A---G--TGGA--GAC--A-----------------TCAAAGT -GG-T---TG--AATA-TTG-----GGCTTTA-------CCAGAAGGT-T G---GGCTTGG--TGGGCTTA--GTT------C-TGGCCTGCCC-TgTCC AAGC-A-C-AGAGTt-GGATC-A-----CGAGGCCCA--AATGAAAAT-- A---------TGG-GCTTCTTGATTCC-T--AAAG----TGG-GGCGGAC C-GCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGC-TCC---CGCT--CT -G-TGCAGTGGA--AGGAT-AATG-GGTCGGTG-TC--TTA---TCAAG- T-T--CA-G-TAA-CGCCTA-AT--GG--GTTGCT-C-CAATAA-ACA-- ACCACCTTT--------  
139 Lycopersicon_EsculentumK                            15.4%  ---------GTT--GAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCA-------- -------A---G--TGGA--GAC--A-----------------TCAAAGT -GG-T---TG--AATA-TTG-----GGCTTTA-------CCAGAAGGT-T G---GGCTTGG--TGGGCTTA--GTT------C-TGGCCTGCCC-TgTCC AAGC-A-C-AGAGTa-GGATC-A-----CGAGGCCCA--AATGAAAAT-- A---------TGG-GCTTCTTGATTCC-T--AAAG----CGG-GGCGGAC C-GCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGC-TCC---CGCT--CT -G-TGCAGTGGA--AGGAT-AATG-GGTCGGTG-TC--TTA---TCAAG- T-T--CA-G-TAA-CGCCTA-AT--GG--GTTGCT-C-CAATAA-ACA-- ACCACCTTT--------  
140 Lycopersicon_EsculentumN                            15.8%  ---------GTT--GAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCA-------- -------A---G--TGGG--GAT--G-----------------TTAATGT -GG-T---GG--AATG-TTG-----GGCTGTA-------CCAGATGGT-T G---GGCTTGG--TGGGCTAA--TTT------C-TGACTTGCCC-TaTCC AAGC-T-T-AGAGTt-GGATC-A-----TGTGGCCCA--ATTGAAGAA-- A---------TGG-ACTACTTGATTCG-T--AAAG----TGG-GGCGGAA T-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTC----GCT--CT -A-AGCGGTGGA--AGGAT-AACG-AGTCGGTG-TT--CT----CTGAG- T-C--CA-G-TAA-CGCCTG-AT--GG--GTTGCT-C-CAATTAAACC-- ACCATTTTT--------  
141 Lycopersicon_EsculentumO                            14.4%  ---------GCC--GAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCA-------- -------A---G--TGGG--GAT--G-----------------TTAAGGT -GG-T---GG--AATA-TTG-----GGCTGTC-------CCAGATGGC-T G---GGCTTGG--TGGGCTAA--TTT------C-TGGCCTGCCC-TaTCC AAGC-A-C-AGAGTt-GGATC-A-----TGTGGTCCA--ATTGAAAGA-- A---------TGG-GCTACTAGATTCC-T--AAAG----TGG-GGTGGAC C-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAAC-TTC---CGCT--TT -G-TGCAGTGGA--AGGAT-AACG-GACCGGTG-CC--TT----CCAAG- T-Tc-CA-T-TAA-TGCCTG-AT--GG--GCTGCT-C-CAATTAAACC-- ACCACTTT---------  
142 Cineraria_Hybrida                                   13.8%  ---------ACC--GGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCA-------- -------A---G--TGAG--GGT--A-----------------TCAAAGT -GG-T---TG--AACTTTGA-----GCTTGGC-------TTAGCTAGT-T G---GGTCTGTA-GACACCGC---AC------C-TGGCTTGCCCGT-TCC AAGT-C-G-AGAGTg-GGTTC-A-----TGTTTCCTG--AGCGAAGGC-- T---------CGG-GTGATGTGAGCTT-T-AGA-A---TCGG-GGGGCAA T-GCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACC-TCT--A-CCT--CT -C-GACTGTGGA--AGGAT-TACA-AGCCGGAG-TG--TC---TT-AGG- C-T--CA-TaTAA-CCAG-C-CT--GG---CTAGC-C-CAACAGGACA-- CCCATTT----------  
143 D_Melanogaster_Chr_arm_3R_12X_1_coverage_(Oct_2000  12.5%  ---------GAC-TGGAAGG-TTGGCA-GCTTCTGTA-ATCA-------- -----CGCTTCTG-TGAG--GTC-----------------------TGAT -TG-T---GG--GATGGCCT---G-AGGCTGG---GA--TCTACTGCG-T A---GCGGACCAGCTCAT-GT---TG------A-CGGAACGTCCGC-ACT AAGC-T-T-GCCAT--CAATAt------GGGTGCCAT--GGAGGAGTC-- C---------GTG-GCATTCAGGTTGG-C-TAAGG----AGG-GATGAAC C-GGGCCAGGGGTGAA--AACCAGCAGCCAAGAGT-TCC---CGTG--GT -A-GGCAGTAGT--GGGAT-AGCG-TACCGGAG-TG--GA----C-TGC- -----CG-T-TAT------C-AGc----CCAACCGaTATGGTTGGACC-- ACAATCTTT--------  
144 D_Melanogaster_Chr_arm_3R_12X_13_coverage_(Oct_200  12.5%  ---------GAC-TGGAAGG-TTGGCA-GCTTCTGTA-ATCA-------- -----CGCTTCTG-TGAG--GTC-----------------------TGAT -TG-T---GG--GATGGCCT---G-AGGCTGG---GA--TCTACTGCG-T A---GCGGACCAGCTCAT-GT---TG------A-CGGAACGTCCGC-ACT AAGC-T-T-GCCAT--CAATAt------GGGTGCCAT--GGAGGAGTC-- C---------GTG-GCATTCAGGTTGG-C-TAAGG----AGG-GATGAAC C-GGGCCAGGGGTGAA--AACCAGCAGCCAAGAGT-TCC---CGTG--GT -A-GGCAGTAGT--GGGAT-AGCG-TACCGGAG-TG--GA----C-TGC- -----CG-T-TAT------C-AGc----CCAACCGaTATGGTTGGACC-- ACAATCTTT--------  
145 CElegans_Chr_III_1                                  10.8%  ---------ACC--GAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCA-------- ------GCTTCT--TGAC--GGT----------------------AGATG -AG-T---GT-GGATGGAGT---G-AGAGGAG---GA-GTCCTGTGTA-T G---TCGTTGTC-AACGTC------G------A-CCGAGCGTCCGT-GCC AAGC-G-C-TGCGT--CACCA-G-----GGGATGACT--GTCGGAAGA-- T---------GGT-CAGTCCCGGGTGC-A-TAAGG----AGT-GGTGGAT --GGTTCAGGACCGAA--AGGTAGCAGACAAAAGC-CAC---CGCG--CG -G-TGCAGTGGC--CGGAC-AGCG-CTTGT--G-AG--TT---GAC-AC- G----TA-T-ACA------C-AGc----CTTCTCAaTACCTTCAGACC-- ACTTGTCACt-------  
146 CElegans_Chr_III_2                                  11.5%  ---------ACC--GAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCA-------- ------GCTTCT--TGAC--GGT----------------------AGATA -AG-T---GT-GGATGGAGT---G-AGAGGAG---GA-GTCCTGTGTA-T G---TCGTTGTC-TACGTC------G------A-CCGAGCGTCCGT-GCC AAGC-G-C-TACGT--CACCA-G-----GGGATAACT--GTCGGAAGG-- C---------GGT-TAGTCCCGGGTGC-A-TAAGG----AGT-CGTGGAT --GGTTCAGGACCGAA--AGGTAGCAGACAAAAGC-GAC---CGCG--TG -G-TGCAGTGGC--CGGAC-CGCG-CTTGT--G-AG--TT---GAC-AC- A----CA-T-ACG------C-AGc----CTTCTCGaTACCTTCAGACC-- ACTTATCATt-------  
147 CElegans_Chr_III_3                                  11.1%  ---------ACC--GAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCA-------- ------GCTTCT--TGAC--GGT----------------------AGATA -AG-T---GT-GGATGGAGT---G-AGAGGAG---GA-GTCCTGTGTA-T G---TCGTCGTC-TACGTC------G------A-CCGAGCGTCCGT-GCC AAGC-G-C-TACGT--CACCA-G-----GGGATAACT--GTCGGAAGG-- C---------GGT-TAGTCCCGGGTGC-A-TAAGG----AGT-CGTGGAT --GGTTCAGGACCGAA--AGGTAGCAGACAAAAGC-GAC---CGCG--TG -G-TGCAGTGGC--CGGAC-CGCG-CTTGT--A-AG--TT---GAC-AC- A----CA-T-ACA------C-AGc----CTTCTCGaTACCTTCAGACC-- ACTTATCATt-------  
148 CElegans_Chr_III_4                                  10.8%  ---------ACC--GAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCA-------- ------GCTTCT--TGAC--GGT----------------------AGATA -AG-T---GT-GGATGGAGT---G-AGAGGAG---GA-GTCCTGTGTA-T G---TCGTTGTC-AACGTC------G------A-CCGAGCGTCCGT-GCC AAGC-G-C-TGCGT--CACCA-G-----GGGATGACT--GTCGGAAGA-- T---------GGT-CAGTCCCGGGTGC-A-TAAGG----AGT-GGTGGAT --GGTTCAGGACCGAA--AGGTAGCAGACAAAAGC-CAC---CGCG--CG -G-TGCAGTGGC--CGGAC-TGCG-CTTGT--G-AG--TT---GAC-AC- G----TA-T-ACA------C-AGc----CTTCTCAaTACCTTCAGACC-- ACTTGTTTTt-------  
149 AC084446_Caenorhabditis_Briggsae                    11.2%  ---------ACC--GGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCA-------- ------GCTTCT--TGAC--GGT----------------------AGACA -AG-T---GT-GGATGGAGT---G-AAGGGAG---GA-GTCCTGTGGG-T G---TTGTCGGC-AACGGC------G------A-CCGAGCGTCCGT-GCC AAGC-G-C-TGCGT--CGCCA-G-----GGGTCTCCG--GTCGGAAGG-- C---------TGG-CGGTCCCGGGCGC-A-TAAGG----AGT-GGTGCAC --GGCTCAGGGCCGAA--AGGCAGCAGGCAAAAGC-CAC---CGCG--CG -G-TGCAGTGGC--CGGAT-AGCG-CTTGT--G-AG--TT---GTCGCT- C-G--CC-C---A------C-AGc----CTCTCTGaTACCTTCAGACC-- ACTTGTCATt-------  
150 XLRN16_Xenopus_laevis_7SL_DNA                       11.3%  ---------GCC--GGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCA-------- ------GCTACT--TGGA--GGC---------------------TTGGGC -TG-T---CG--GATCGCTT---G-AGTCCAT---GA-GTTCTGGGC--T G---CACTGAGC-TATGTC------G------A-TCGGGTGTCCGC-ACT AAGT-T-C-GGTAT--CAATAt------GGTTTTCCT--GGGGGAGCC-- T---------CGG-ATCACCAGGTTGCtC-TAAGG----AGG-GGTGAAC C-GGCCTAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAAC-CCC---CGTG--CC -G-ATCAGTAGT--GGGAT-CGCG-CCTGT--G-AA--TA---GC-CGG- T-G--C----AGAA-----C-AGc----CTGAACAaCACAGCGAGAC--- ACAGTTCT---------  
151 FR40756_Fugu_rubripes                               10.2%  ---------GCC--GGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCA-------- -----AGCTACTG--GGA--GGC----------------------TGAGG -CT-G---GC-GGATCGCTT---G-AGCTCAG---GA-GTTCTGGGC--T T---CAGCGGAC-TATGTC------G------A-TCGGGTGTCCGT-ACT AAGT-T-C-GGTAT--CGATAt------GGTGCTCCT--GGGGGAGCC-- C---------GGG-ATCACCAGGTCGC-C-TAAGG----AGG-GGTGCCC C-GGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGC-CCC---CGTG--CC -G-CTCAGTAGT--GGGAT-CGCG-CCCGT--G-AA--TA---GAC-GC- T-G--T----AGTT-----C-AAc----CTGAGTAaCACAGCGGGACT-- CAGTCTTT---------  
152 Rattus_Rattus                                       12.8%  ---------GCC--GGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCC-------- -----AGCTACTC-GGGA--GGC----------------------TGAGG -AC-A---GA-GGATCGCTT---G-AGTCCAG---GA-GTTCTGGGC--T G---TAGTGCGC-TATGCC------G------A-TCGGGTGTCCGC-ACT AAGT-T-C-GGCAT--CAATAt------GGTGACCTC--CCGGGAGCG-- G---------GGG-ACCACCAGGTTGC-C-TAAGG----AGG-GGTGAAC C-GGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAAC-TCC---CGTG--CT -G-ATCAGTAGT--GGGAT-CGCG-CCTGT--G-AA--TA---GC-CAC- T-G--C----ACTC-----C-AGc----CTGGGCAaCATAGCGAGACC-- CCGTCTCT---------  
153 AC091616_Rattus_norvegicus                          12.9%  ---------GCC--GGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCC-------- -----AGCTACTC-GGGA--GGC----------------------TGAGA -CA-G---GA-GGATCGATT---G-AGTCCAG---GA-GTTCTGGGC--T G---TAGTGCGC-TATGCC------G------A-TCGGGTGTCCGC-ACT AAGT-T-C-GGCAT--CAATAt------GGTGACCTC--CCGGGAGCG-- G---------GGG-ACCACCAGGTTGC-C-TAAGG----AGG-GGTGAAC C-GGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAAC-TCC---CGTG--CT -G-ATCAGTAGT--GGGAT-CGCG-CCTGT--G-AA--TA---GC-CAC- T-G--C----ACTC-----C-AGc----CTGGGCAaCATAGCGAGA-C-- CCGTCTCT---------  
154 AB021174_Oryctolagus_cuniculus                      12.8%  ---------GCC--GGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCC-------- -----AGCTACTC-GGGA--GGC----------------------TGAGG -CC-G---GA-GGATCGCTT---G-AGTCCAG---GA-GTTCTGGGC--T G---TCGTGCGC-TATGCC------G------A-TCGGGTGTCCGC-ACT AAGT-T-C-GGCAT--CAATAt------GGTGACCTC--CCGGGAGCG-- G---------GGG-ACCACCAGGTTGC-C-TAAGG----AGG-GGTGAAC C-GGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAAC-TCC---CGTG--CT -G-ATCAGTAGT--GGGAT-CGCG-CCTGT--G-AA--TA---GC-CAC- T-G--C----ACTC-----C-AGc----CTGGGCAaCATAGCGAGACC-- CTGTCTCC---------  
155 Canis_Species                                       12.8%  ---------GCC--GGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCC-------- -----AGCTACTC-GGGA--GGC----------------------TGAGG -CA-G---GA-GGATCGCTT---G-AGCCCAG---GA-GTTCTGGGC--T G---CAGTGCGC-TATGCC------G------A-TCGGGTGTCCGC-ACT AAGT-T-C-GGCAT--CAATAt------GGTGACCTC--CCGGGAGCG-- G---------GGG-ACCACCAGGTTGC-C-TAAGG----AGG-GGTGAAC C-GGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAAC-TCC---CGTG--CT -G-ATCAGTAGT--GGGAT-CGCG-CCTGT--G-AA--TA---GC-CAC- T-G--C----ACTC-----C-AGc----CTGTGCAaCATAGCGAGACC-- CCGTCTCT---------  
156 CNS01DX7_HSapiens_chr_14_DNA_seq_BAC_R649E7         12.8%  ---------GCC--GGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCC-------- -----AGCTACTC-GGGA--GGC----------------------TGAGG -CT-G---GA-GGATCGCTT---G-AGTCCAG---GA-GTTCTGGGC--T G---TAGTGCGC-TATGCC------G------A-TCGGGTGTCCGC-ACT AAGT-T-C-GGCAT--CAATAt------GGTGACCTC--CCGGGAGCG-- G---------GGG-ACCACCAGGTTGC-C-TAAGG----AGG-GGTGAAC C-GGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAAC-TCC---CGTG--CT -G-ATCAGTAGT--GGGAT-CGCG-CCTGT--G-AA--TA---GC-CAC- T-G--C----ACTC-----C-AGc----CTGGGCAaCATAGCGAGACC-- CCGTCTCTT--------  
157 AC020711_1_HSapiens_chr_14_clone_RP11429A17,_WORK   12.5%  ---------GCC--GGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCC-------- -----AGCTACTC-GGGA--GGC----------------------TGAGG -TG-G---GA-GGATCGCTT---G-AGCCCAG---GA-GTTCTGGGC--T G---TAGTGCGC-TATGCC------G------A-TCGGGTGTCCGC-ACT AAGT-T-C-GGCAT--CAATAt------GGTGACCTC--CCGGGAGCG-- G---------GGG-ACCACCAGGTTGC-C-TAAGG----AGG-GGTGAAC C-GGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAAC-TCC---CGTG--CT -G-ATCAGTAGT--GGGAT-CGCG-CCTGT--G-AA--TA---GC-CTC- T-G--C----TCTC-----C-AGc----CTGAGCAaCATAGCGAGACC-- CCGTCTCTT--------  

MView 1.41, Copyright © Nigel P. Brown, 1997-1999.