Identities computed with respect to: (1) AP001507_Bacillus_halodurans_g
Colored by: consensus/80% and property
 1 AP001507_Bacillus_halodurans_g 100.0%  CCGTGCTAGGT-GGGGAGG----TAGCGG-TGCCCTGT------------ ----C-ACTCGCAAT-CCGCTATAG-CGAG-GC-T-G---A-AT-CCCTT CTA-GAGGTTTTG----TCACCGTAGGGTCTG-CCCT-AAGTA-AGT-GG TGT-TGA-CGCTTGGGTT-CTACG-CAACGAAA----------------- ---------------------------ACCCACG-AACCCTGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCAGTAAGTGGCCCCTTTCGTGTG-CCGTAGAGTCGC-C TGGGCCGAGCTAA-C-TGCTCAGG-TAAC---GCCTAGGGTGGC---ATG ATCG-AAGGAAGG---TGCACGG  
 2 BAALSCR_B_alcalophilus_gene_fo  94.8%  CCGTGCTAAGC-GGGGAGG----TAGCGG-TGCCCTGT------------ ----A--CTCGCAAT-CCGCTATAG-CA-G-GC-T-G---A-AT-CCCTT CTA-GAGGTTTTG----TCACCGTAGGCTCTG-CCCT-AAGTA-AGT-GG TGT-TGA-CGTTGG-GTT-CTACG-CAACGAAA----------------- ---------------------------ACCCACG-AACCCTGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCAGTAAGTGGCCCCTTTCGTGTG-CCGTAGAGTCGC-- TGGGCCGAGCTAA-C-TGCTCAGG-TAAC---G-CTAGGGTGGC---ATG ATCG-ACAGAAGG---TGCACGG  
 3 BAASCR_B_amyloliquefaciens_gen  81.6%  CCGTGCTAAGC-GGGGAGG----TAGCGG-TGCCCTGT------------ ----A--CCTGCAAT-CCGCTCTAG-CAGG-GC-C-G---A-AT-CCCTT CTC-GAGGTTCGT----TTACTTTAAGGCCTG-CCTT-AAGTA-AGT-GG TGT-TGA-CGTTTGGGTC-CTGCG-CAATGGGA----------------- ---------------------------ATTCATG-AACCATGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCATTAAGTGAAACCTCTCATGTG-CCGCAGGGTTGC-C TGGGCCGAGCTAA-C-TGCTTAAG-TAAC---GCTTAGGGTAG----CGA ATCG-ACAGAAGG---TGCACGG  
 4 BBSCRNA_Bacillus_brevis_gene_f  70.2%  CCGTGCTAGAC-GGGGAGG----TTGCGG-TGCCCTGT------------ ----A-ACCTGCAAT-CCGCAATAGCCAGG-GTgT-G---A-AT-TCCTA TCC-TAGGTTTT-----CTTATGTGAGG-CTG-CCGTtGATGGCGGC-GG TGT-TGA-GGAGCGGGTC-CTGTG-CAACGCGA----------------- ---------------------------ACCCATG-AACCTGGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCCATAAGTGGATCATCGCGTGTG-CCGCAGGGTAGC-C TGCTCTGAGCTGC-TACCAT-AAG-TAAC---GCTCGGATAAGG---ATT ATCG-AAGATAGG---TGCACGG  
 5 BCCISCR_B_circulans_gene_for_s  78.7%  CCGTGCTAAGCGGGGGAGG----TAGCGG-TGCCCTGT------------ ----A--CTCGCAAT-CCGCTCTAG-CGAG-GC-T-G---A-AT-TCCTT TCT-GAGGCTGGT----ATCCTGTAGGGTCTG-CCTT-AAGTA-AGT-GG TGT-TGA-CGTCCGGGTC-CTGCG-CAATGGGA----------------- ---------------------------ATCCATG-AACCATGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCATTAAGTGGACACCCCCATGTG-CCGCAGGGTTAC-C TGGACTGAGCTAA-C-TACTTAAG-TAAC---GCTTATGGGTG----CCA GTCG-ACAGAAGG---TGCACGG  
 6 BCCSCR_B_cereus_gene_for_small  81.0%  CCGTGCTAAGCGGGGGAGG----TAGCGG-TGCCCTAT------------ ----A--CTCGCAAT-CCGCTCTAG-CA-G-GC-C-G---A-AT-CCCCT CTC-GAGGTTATG----TTGCTGTAAGGTCTG-CCTT-AAGTA-AGT-GG TGT-TGA-CGTTTGGGTC-CTGCG-CAACGGGA----------------- ----------------------------CCCGTG-AACCTTGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCAATAAGCGGT-CTTCTCGTGTG-CCG-AGAGTG-C-C TGAACCGAGCTAA-C-TGCTTGAG-TAAC---G-TTATGGTAC----GTA ATCG-ACAGAAGG---TGCACGG  
 7 BMMASCR_B_macerans_gene_for_sm  79.5%  CCGTGCTAAGCAGGCGAGG----TAGCGG-TGCCCCAT------------ ----A--CCCGCAAT-CCGCTCTAG-GAGG-GC-C-G---A-AT-CCCTT CTC-GAGGTTCGT----TTACTGTAAGGTCTG-CCTT-AAGTA-AGT-GG CGT-TGA-CGTCTGGGTC-CTGCG-CAATGGGA----------------- ---------------------------ATTCATG-AACCATGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCATTAAGTGAAACCTCTCATGTG-CCGCAGGGTTGC-C TGGGCTGAGCTAA-C-TGCTTAAG-TAAC---GCTTAGGGTAG----CGA ATCG-ACAGAAGG---AGCACGG  
 8 BMMSCR_B_megaterium_gene_for_s  83.1%  CCGTGCTAAGC-GGGGAGG----TAGCGG-TGCCCTGT------------ ----A--CTCGCAAT-CCGCTCTAG-CA-G-GC-C-G---A-AT-TCCTT CTT-GAGGTTAGC----TCATCTTAGGGCCTG-CCTT-AAGTA-AGT-GG TGT-TGA-CGTTTGGGTC-CTACG-CAATGGGA----------------- ---------------------------ATCTGTG-AACCCTGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCAGTAAGCAGAACCTCTCATGTG-CCATGGGGTCGC-C TGAACCGAGCTAA-C-TGCTTAAG-TAAC---GCCTGGGGTGG----CTA ATCG-ACAGAAGG---TGCACGG  
 9 BPPOSCR_B_polymyxa_gene_for_sm  81.3%  CCGTGCTAAGCGGGGGAGG----TAGCGG-TGCCCTGT------------ ----A--CCTGCAAT-CCGCTCTAG-CAGG-GC-C-G---A-AT-CCCTT CTC-GAGGTTCGT----TTACTTTAAGGCCTG-CCTT-AAGTA-AGT-GG TGT-TGA-CGTTTGGGTC-CTGCG-CAATGGGA----------------- ---------------------------ATTCATG-AACCATGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCATTAAGTGAAACCTCTCATGTG-CCGCAGGGTTGC-C TGGGCCGAGCTAA-C-TGCTTAAG-TAAC---GCTTAGGGTAG----CGA ATCG-ACAGAAGG---TGCACGG  
10 BPPSCR_B_pumilus_gene_for_smal  80.9%  CCGTGCTAAGC-GGGGAGG----TAGCGG-TGCCCTGT------------ ----A--CTCGCAAT-CCGCTCTAG-CA-G-GC-C-G---A-AT-CCCTT CTC-GAGGTTCGT----TTACTTCAAGGTCTG-CCTT-AAATA-AGT-GG TGT-TGA-CGTCTGGGTC-CTGCG-CAATGGGA----------------- ---------------------------ATTCATG-AACCATGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCATTAAGTGAAACCTCTCATGTG-CCGCAGGGTTGC-C TGGGCCGAGCTAA-C-TGTTTAAG-TAAC---GCTTGGGGTAG----CGA ATCG-ACAGAAGG---TGCACGG  
11 BSORF17_Bacillus_subtilis_DNA_  81.6%  CCGTGCTAAGC-GGGGAGG----TAGCGG-TGCCCTGT------------ ----A--CCTGCAAT-CCGCTCTAG-CAGG-GC-C-G---A-AT-CCCTT CTC-GAGGTTCGT----TTACTTTAAGGCCTG-CCTT-AAGTA-AGT-GG TGT-TGA-CGTTTGGGTC-CTGCG-CAATGGGA----------------- ---------------------------ATTCATG-AACCATGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCATTAAGTGAAACCTCTCATGTG-CCGCAGGGTTGC-C TGGGCCGAGCTAA-C-TGCTTAAG-TAAC---GCTTAGGGTAG----CGA ATCG-ACAGAAGG---TGCACGG  
12 BSSCR_Bacillus_stearothermophi  77.5%  CCGTGCTAAGC-GGGGAGG----TAGCGG-TGCCCTGT------------ ----A--CTCGCAAT-CCGCTCTAG-CGAG-GC-T-G---A-AT-CCCTT CTC-GAGGTTAGT----CTGTTGTGAGGCCTG-TCTC-AAGTA-AGT-GG TGT-TGA-CGTCTGGGTC-CCGCG-CAATGGGA----------------- ---------------------------TTCCGTG-AACCCTGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCAGTTAGCGGATGCTCCCATGTG-CCGCGGGGGCGC-C TGGGCTGAGCCAA-C-TGCTTGAG-CAAC---GCTCGGGGCAG----CTA ATCG-ACAGAAGG---TGCACGG  
13 BSSPSCR_B_sphaericus_gene_for_  80.5%  CCGTGCTAAGC-GGGGAGG----TAGCGG-TGCCCTGT------------ ----A--CCTGCAAT-CCGCTCTAG-CAGG-GC-C-G---A-AT-CCCTT CTC-GAGGTTCGT----TTACTTTAAGGCCTG-CCTT-AAGTA-AGT-GG TGT-TGA-CGTTTGGGTC-CTGCG-CAATGGGA----------------- ---------------------------ATTCATG-AACCATGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCATTAAGTGAAACCTCTCATGTG-CCGCAGGTTGCC-T TGGGCCGAGCTAA-C-TGCTTAAG-TAAC---GCTTAGGGTAG----CGA ATCG-ACAGAAGG---TGCACGG  
14 BTTSCR_B_thuringiensis_gene_fo  80.5%  CCGTGCTAAGC-GGGGAGG----TAGCGG-TGCCCTAT------------ ----A--CTCGCAAT-CCGCTCTAG-CA-G-GC-C-G---A-AT-CCCCT CTC-GAGGTTATG----TTGCTGTAAGGTCTG-CCTT-AAGTA-AGT-GG TGT-TGA-CGTTTGGGTC-CTGCG-CAACGGGA----------------- ---------------------------CCCCGTG-AACCTTGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCAATAAGCGGGTCTTCTCGTGTG-CCGCAGGAGTGC-C TGAACCGAGCTAA-C-TGCTTGCG-TAAC---GCTTATGGCTAC---GCA ATCG-ACAGAAGG---TGCACGG  
15 AE007525_Clostridium_acetobuty  67.4%  --GTGCTAGAC-GGGGAGT----TAGCGG-TGCCTTGT------------ ----A--CCTGCAAT-CCGCTGTAG-CAGG-GT-T-G---A-AT-TCCTT GTTTGAGGCTAT-----AATTTGTGGGGTTTG-CCTC-ATCTT-GGTcAA TGT-TGA-GAATTGGGTC-CCACG-CAACGGAA----------------- ---------------------------ATTCATG-AACTCCGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCGGTAAGTGAAATCTTCCGTGTG-CCGTGGATAAAT-C TGATTTGAGTTGA-C-CAGGTGAG-TAAC---ACTCATAGATT----ATT GTCG-ATTCAAGG---TGCAC--  
16 CPSERTRNA_Clostridium_perfring  73.8%  CCGTGCTAGAT-GGGGAGT----TAGCGG-TGCCCTGT------------ ----A-ACCTGCAAT-CCGCTACAG-CAGG-AT-C-G---A-AG-TCCTC ATA-GAGGCTCT-----AACTTGTGGAGTCTG-CCCT-ATGTA-AGT-GG TGT-TGA-GAGTTGGGCC-CCACG-CAATGGAA----------------- ---------------------------ACCTGTG-AACCTCGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCGATAAGCAGTCATTTTCATGTG-CCGTGGATACGT-C TGGCTTGAGCTAA-C-TGCATAGG-TAAC---GTTCATAAGTT----ATT GTCG-AAGTGAGG---TGCACGG  
17 AF269814_Staphylococcus_epider  70.2%  CCGTGCTAGGT-GGGGAGG----TAGCGG-TTCCCTGT------------ ----A--CTCGAAAT-CCGCTTTATGCGAG-AC-T-T---A-ATtCCTTT GTT-GAGGACGTA----TTTTTGTGAAGTCTG-CCCG-AAGCA-CGT-AG TGTtTGAAGATTTCGGTC-CTATG-CAATATGA----------------- ---------------------------ACCCATG-AACCATGTCAGGTCC TGACGGAAGCAGCATTAAGTGGATCCTCATATGTG-CCGTAGGGTAGC-C GAGATTTAGCTGT-C-GACTTCGG-TAAC---GTTTATGATAT----GCG TTCG-ATACAAAGG--TGCATGG  
18 AF368293_Staphylococcus_aureus  69.1%  CCGTGCTAGGT-GGGGAGG----TAGCGG-TTCCCTGT------------ ----A--CTCGAAAT-CCGCTTTATGCGAG-GC-T-T---A-AT-TCCTT TGTTGAGGCCGTA----TTTTTGCGAAGTCTG-CCCA-AAGCA-CGT-AG TGTtTGAAGATTTCGGTC-CTATG-CAATATGA----------------- ---------------------------ACCCATG-AACCATGTCAGGTCC TGACGGAAGCAGCATTAAGTGGATCATCATATGTG-CCGTAGGGTAGC-C GAGATTTAGCTAA-C-GACTTTGG-TTAC---GTTCGTGAATT----ACG TTCGATGCTTAGG---TGCACGG  
19 AL591984_Listeria_monocytogene  73.3%  --GTGCTAGAC-GGGGAGG----TAGCGG-CGCCCTGT------------ ----A-ACCCGCAAT-CCGCTCTAG-CGGG-GT-T-G---A-AT-TCCTC ATTTGAGGCATCG----TAATTGTTTGGTCTG-CCCT-TGACA-AGT-GG TGT-TGA-AGGTTGGGTC-TTGCG-CAATGGGA----------------- ---------------------------ACCTGTG-AACCATGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCATTAAGCAGTGCTTCTCATGTG-CCGCGAGGTCGC-C TGGCCCGAGCTAA-C-TATCAGGG-TAAC---GCAGATGATTG----CAT GTCG-ATGTGAGG---TGCGC--  
20 AL596173_Listeria_innocua_Clip  72.6%  --GTGCTAGAC-GGGGAGG----TAGCGG-CGCCCTGT------------ ----A-ACCCGCAAT-CCGCTCTAG-CGGG-GT-T-G---A-AT-TCCTC ATTTGAGGCATCG----TAATTGTTTGGTCTG-CCCT-TGACA-AGT-GG TGT-TGA-AGGTTGGGTC-TTGCG-CAATGGGA----------------- ---------------------------ACCTGTG-AACCATGTCAGGTCC GGAAGGAAGCAGCATTAATCAGTGCTTCTCATGTG-CCGCGAGGTTGC-C TGGCCCGAGCTAA-C-TATCAAGG-TAAC---GCAGGTGATTG----CAT GTCG-AGGTGAGG---TGCGC--  
21 AE001769_Thermotoga_maritima_s  61.5%  CCACGCTAGGC--GGGGGG---CTGGCGG-TCCCCTGT------------ ----A--CCCGAAAT-CCGCCGTACGCGGG-GC-C-G---A-AT-TCCCA CCC-GAGGCTCT-----TCGGGTCGGGAAACG-GCGT-GACTC-GGG-GG CGA-TGA-AGACCGGGTC-CCACG-CAACGGAA----------------- ---------------------------CCCTGTG-AACCTGGTCAGGCCC GGGAGGGAGCAGCCATAAGCAGGTGTTTCCGTGTG-CCGTGGGGGAGC-C CGGTTGGAGCCTT-C-CGATCATG-CACG---CCCCGGTCCGG---AGAA GTCG-ACGGTGGG---TGCGTGG  
22 PORG7SA_Pyrodictuim_occultum__  34.2%  --CGGGTAGGGC-CGGGGG---CTCGCCC-TCCCCCG------------- ----AGCCCCGAAAT-GGGCGTAATGCGGGGGC-CAG--TA-AC-CCGCA CGT-CGGCCGTA-----GTGGTCCAGGG-CAG--ACC-CGGCC-GACcCA T----GA-C-CCCCG-TCCCGCGGGGCC-GGCG-GCGCGGAG-CC-CCCT CCGGAGGGAGGGAGGCTaCCGCCCTTACCGGGGG-AACCAGGCCAGGCCC GGAAGGGAGCAACCTA-ACCCCGG-ACGCCCG-GCGTTCGCGGGGCCA-C GGGG-TGAGGCAA-C-GGCCGGGC-CCCCtg-CCCTGGGCCCC----TAC GGCT-GGCGTGCGGGG-GCCG--  
23 AP000058_Aeropyrum_pernix_geno  33.7%  CCGAGGAAGGGC-CGGAGGgca-CCGCCG--ACCCTCCgcccccagccat gggg-GCCCCGAA----GGCGCCACGCGGGGGC-CAGaaGA-AC-CCGCC CCCAGAGCTTGAAGc-AGGCCAGCAAGGG-----CCT-GCAGG-GTA-CA AT---GA-A-CCCCG-TCCCGCGGGGCC-GGCG-GAGGCGGG-CGgCCAG CCGGAGGGCCGGCCGAAgCCGCCGTAG-CCGGGGCCACCCGGCGAGGCCC GGAAGGGAGCAGCCGA-CCCCGG--CCGACCG-GCGTTCGCGGGGGGAaC GGGG-GGAG--AAgC-CCTGCAGG-GTAA----CCCTCTGGCCTgcTTCA AACTCTGGGAGCGGGG-GCTCGG  
24 AE006647_Sulfolobus_solfataric  35.6%  --CAGGGAGGGTGGGGGAT---CTCGCCA-ATCCCTAT------------ ----T-ACCCGCAA---GGCGTAATGCGGGCAC-CAG--TA-AC-TCCTA CCC-TATGGTGTCTc-CTATCTGTAGG-------TCC-CAGTG-GAG-CG AT---GA-AGGCT-G-CCCAGCGGGGCTTGGCG-GTCATGGGcTTtCTCT CCGGAGGGAGAGAAAGTaCCATGATAG-CTGGGGGAAT-CGGCGAGGCCC GGAAGGGAGCAGCCGT-GCCTGG---ACGCCA-GCGTTCGCTGGTCAA-C -AGCCAGAG--TG-A-AACTGGGG-TAAA----CCTATAGATAGg-TAGG CCAT-GGGGTAGGGGG-TCTG--  
25 AP000988_Sulfolobus_tokodaii_g  33.2%  --CGGGTAGGGTGGGGAGT---CTCGCCA-GCTCCTGT------------ ----A-ACCCCGT----GGCGTAATGGGGC-AC-CAG--TA-AC-CCTTA TGC-CATGATACCT--ACCTCTCTAGA-------TCC-C-AGCTGAA-CG AT---GA-G-CACCG-CCCGGTGGGGCGAGACG-GACGCGAAtCTcCTCT CTGGAGGGAGAGGGGATaTCGCG-TCAACCGGAGGAAT-CGGCCAGGTCC GGAAGGGAGCAACCGT-GTCCGGC--CG-TCC-GCGTTCACCGGTCAC-C GGTG-TGAG--AA-AGGCTGGGGG-TAAA----TCTAGAGAGGAa-AGGA TCAT-GGCATAAGGGG-GCCG--  
26 SS7SRNA_UNKNOWN_Sulfolobus_rel  32.7%  --CAGGTAGGGTGGAGGGT---CTCGCCA-GCCCTTAT------------ ----A--CCCACA---TGGCGCAACGTGGGCAC-CAG--TA-AC-TCCTA TGC-TATAATACC----TGCTCTTCGAG-----ATCC-CAGTC-TAA-CT AT---GA-T-CATCG-CCCGACGGGGCG-AGATaGTCGTGGGtTCcCTTT CTGGAGGGAGAGGGAAT-TCCACGTTGACCGGGGGAAC-CGGCCAGGCCC GGAAGGGAGCAACCGT-GCCCGGC-TAT-C-C-GCGTTCGTCGGTCTC-C GATA-GGAG--GA-A-GACTGGGG-GTAA-atCTCGGGGAGTA---AGGG TTAT-GGCATAGGGGA-GCTG--  
27 AE001042_Archaeoglobus_fulgidu  33.7%  --GGGCTAGGCC-GGGGGG---TTCGGCG-TCCCCTGT------------ ----A-ACCCGAAAC-CGCCGATACGCGGGGGC-C-G---A-AG-CC-GA GGG-GAGGCCTGTC--AAGCGGGCGGCAG----CGGT-TCCAGGCAC-CG CA---GA-GTCCTCG-TCCCGGAGGGCC-GGCG-GTTATGGCcGGgCTGC CCGGAGGGGCTGTCCG--CCATATTAGCCGGGGGGAAC-GGCCCAGGCCC GGAAGGGAGCAGGCTA-ACCCCGG-ACGACCG-GCGCTTCCGGGGGTG-C GGGGAGGAG--GT-GCCTGGGGCT-TCAA----GCCGCCCGTAAg-GCAG GTCG-ACCCG-AGGCGTGCCC--  
28 AE005009_Halobacterium_sp_NRC1  33.3%  --GGACTAGGCC-GGGCGG---TTTGGCTcCGCCCGAC------------ ----ACCCGTGAGAC-AGTCATCAG-CGGGGGC-C-G---A-AC-AC-CG GGCGCGTCCGACC---GCCGCGGTCGGG-----CCCC-GGAAGCCAA-CG TG---GA-AGCCTCG-TCCGTCGGGGAC-GGCG-GTCCGCGG-CGtGCGC CCGCAGGGGCGTTCCGT-CGTGGTTCGACGGTGGCAAC-CCGCCAGGCAC GGAAGTGAGCAGCGGA-CCACCGA-ACGCCCG-TCGCTCGACGGGTCG-C GGGGTGGAG--AA-GGCGACCGGG-ACTA---CCCGGCCGGGAA--CGCC GGGCTACCCCGAC---TGTCC--  
29 AF395888_Haloferax_volcanii_si  33.5%  --GGACTAGGTC-GGGCAG---TTAGGCCcTGCTCTTC------------ ----ACCCGCGAAATaGGTCTTTAG-CGGGGAC-C-G---A-AC---ACG GGCGCGTCCGGTCAg-ACCGGCGCGGG------CCCC-GGAAGCCAA-CG TA---GA-AACCTCG-TCCTTCGGGGAC-AGCG-GTTCCGCGtACcCCTT CCGCAGGGAAGGGTTCG-CGCGGTTTATCGGTGG-TACCCCGCCAGGCGC GGAAGCGAGCAGCGGA-CCATCGG-ACGTGCG-TCGCTCGAGGGATCG-C GGGGTGGAG--GA-GGCAACCGGG-ATTC----CCCACGTCGGAa-CGCC GGGCAACCTCGC----TGTCC--  
30 MFTGSRNA_Mfervidus_7S_RNA__Ser  34.9%  --AGGCTAGGCC-GGGGGG---TTAGGGG-TCCCCTGT------------ ----A-AGCGCAAAT-CCCCTATATGGCGCGGC-C-G---A-AG-CCCAG GAGGCGGCAAGACCg-CCAGACATCGG------CCTG-AGGGTTAAA-CA AT---GA-AGCCTCG-TCCCACAGGGCC-ACCG-GTGGCGAG-GGtCCAG CTGGAGGGCTGGACCTAaTCGCCTTTGCTGCGGG-AAC-GGGTCAGGCCC GGAAGGGAGCAGCCCT-ACCGCAG-ACGGATG-GTGCTTGTGGGTCAA-C GGGGTGGAGTCTA-TAACCCTCAG-ATCA----CCGGTGTCTGGtgGTCT TGTCCACTCCTGGGCGTGCCT--  
31 MTRRNOPE_Methanobacterium_ther  33.9%  --GGGCTAGACC-GGAGGG---TTAGGGG-TCCTCTGT------------ ----A-AGCGCAAAT-CCCCTATACGGCGCGGT-C-G---A-AG-TTCAG GGGACGGCTGATCGa-CTGTTTATCGG------CCCT-GCTGATTGG-TG TC---GA-AGCCTCG-TCCCGCAGGATC-AGTG-GTGATGGG-GCcCTGA CTGGAGGGTCAGGGTAAaCCATCTTAGTCATGGG-AAC-GGGTCAGGCCT GGAAAGGAGCAGCCCT-ACCATGG-ACAGCTG-ATGCTTGCGGATTAA-C GGGGTGGAG--CC-AGTCAGCGGG-ATCA----CCGGTAAATGGaaGGTC TGTCAACCCCTGAACGTGCCC--  
32 AE000940_Methanobacterium_ther  36.4%  --GGGCTAGACC-GGAGGG---TTAGGGG-TCCTCTGT------------ ----A-AGCGCAAAT-CCCCTATATGGCGCGGT-T-G---A-AG-TTCGG GGGACGGCTGATTGa-CTGTCCATCGG------CCCT-GATGGTCGG-TG TC---GA-AGCCTCG-TCCCGCAGGATC-AGTG-GTGATGGG-GCcCTGA CTGGAGGGTCAGGGTAAaCCATCTTAGTCATGGG-AAC-GGGTCAGGCCT GGAAAGGAGCAGCCCT-ACCATGG-ACAGCTG-ATGCTTGCGGATTAA-C GGGGTGGAG--CC-GGTCATCAGG-ATCA----CCGGCGGATGGaaGATC TGTCAACCCCTGAACGTGCCC--  
33 MJU67510_Methanococcus_jannasc  36.4%  --TGGCTAGGCC-GGGGGG---TTGGGCG-TCCCCTGT------------ ----A-ACCCGAAAT-CGCCCTTATGCGGGGGC-C-G---A-AA-ACTTG GGGGCGGCATGTCCt-CCAGTCCTTCC------TTCC-CAGACTCCT-CG AT---GA-GGTCTCG-TCCCGTGGGGCTCGGCG-GTGGGGGA-GCaTCTC CTGTAGGGGAGATGTAA-CCCCCTTTACCTGCCG-AACCCCGCCAGGCCC GGAAGGGAGCAACGGT-AGGCAGG-ACG-TCG-GCGCTCACGGGGGTG-C GGGACGGAG--AAgGAATCTGGGG-GCGA----GGGAGGACTGGagGACA TGCCCACCCCAAGGAA-GCCA--  
34 MV7S_Mvoltae_7S_ribosomal_RNA_  39.9%  --TGGCTAGGCT-GGGAGG---TTAGGCG-TCTCCTGT------------ ----A-ACTTGAAAT-CGCCTTT-G-CGAGAGC-C-G---A-AA-ACTTG GGGGCGGCATAAGTtcCCAAATTTCAT------TCTT-AATTA-GTA-TG TC---GA-CGTTTCG-TCCTTTGGGGTAAGATG-GTAAGAGA-CTcTCTT TCTTAAGAAAGAGTCAAaCTCTTTTCGTATTTCG-AAACCCGCCAGGCCC GGAAGGGAGCAACGGT-AGAATTT-ACT-TCG-ACGCTCAAGGGGTAG-C GGGGCTGAG--TA-C-TAATTAAGgCAAA----ATGAGATTTGGtgCTTT TGTCCACCCCAAGGAA-GCCA--  
35 MA7SRNA_Macetivorans_7S_RNA_ge  33.5%  --GAGCTAGTCC-GGGTAG---CCCGGCG-TTACCTGT------------ ----A-ACCCGAAAT-CGCCGATATGCGGGGGA-C-G---A-AG-CCAAT GGAAGATGCGTCAA--AGGGATTCCAG------CCTG-TGATCTCAA-CT GA---GA-AACCCCG-TCCTGCTTGGAT-GATG-CAGGTATGtGGaCTTG CTGGAAAACAGGTCCTC-ATACCCTAACTGCGGA-AACCGGTCGAGGCCC GGAAGGGAGCAGACTC-ACTGTGG-GCAACCG-TCGCTTGCGGGGTCG-C GGGGTGGAG--AA-GAGATTCCAG-TCTA----CTGAAATCTCCc-AGAT ACAACGACCTGCGGTGTGCTC--  
36 CNSPAX01_Pyrococcus_abyssi_com  37.5%  --GGGCTAGGCC-GGGGGG---TTCGGCG-TCCCCTGT------------ ----A-ACCGGAAAC-CGCCGATATGCCGGGGC-C-G---A-AG-CCCGA GGGGCGGTTCCCG---AAGCCGCCTCCGG---AAGCC-AGGGCCGAA-CG AT---GA-GTCCTCG-TCCCGCGGGGTG-CCCG-GTGGGGGA-GGcACGG CTGAAGGGCCGTGCTAA-CCCCCTTTAGGCCCCA-AACCCCGCAAGGCCC GGAAGGGAGCAGCGGT-AGGGGCC-ACGGAGC-ACGCTCGCGGGGGTG-C GGGGATGAG--GT-AGGCCCTGGT-GAAA----GGAGGCGGTGG--AGGG TTCCCACCCTCGGGCGTGCCC--  
37 AP000001_Pyrococcus_horikoshii  37.5%  --GGGCTAGGCC-GGGGGG---TTCGGCG-TCCCCTGT------------ ----A-ACCGGAAAC-CGCCGATATGCCGGGGC-C-G---A-AG-CCCGA GGGGCGGTTCCCG---AAGCCGCCTCTGG---AAGCC-AGGGCCGAA-CG AT---GA-GTCCTCG-TCCCGCGGGGTG-CCCG-GTGGGGGA-GGcACGG CTGAAGGGCCGTGCTAA-CCCCCTTTGGGCCCCA-AACCCCGCAAGGCCC GGAAGGGAGCAGCGGT-AGGGGCC-ACGGAGC-ACGCTCGCGGGGGTG-C GGGGATGAG--GT-AGGCCCTGGT-GAAA----GGAGGCGGTGG--AGGG TTCCCACCCTCGGGCGTGCCC--  
38 AL445063_Pyrococcus_furiosus_S  38.4%  --GGGCTAGGCC-GGGGGG---TTCGGCG-TCCCCTGT------------ ----A-ACCGGAAAC-CGCCGATATGCCGGGGC-C-G---A-AG-CCCGG GGGGCGGTTCCCA---AAGCCGCTCCCAG---AAGCC-GAGGTCGAA-CG AT---GA-GTCCTCG-TCCCGCGGGGTG-CCCG-GTGGGGGA-GGcACGG CTGAAGGGCCGTGCTAA-CCCCCTTTGGGCCCCG-AACCCCGCAAGGCCC GGAAGGGAGCAGCGGT-AGGGGCC-ACGGAGC-ACGCTCGCGGGGGTG-C GGGGATGAG--AT-AGGCCTCGGT-GGAT----GGGAGCGGTGG--AGGG TTCCCACCCTCGGGCGTGCCC--  
39 AP000996_Thermoplasma_volcaniu  37.3%  CCAGACTTGGCC-GGGGGG---TTAGGCG-TCCCCTGT------------ ----A--CCCGAA----GTCTAGATGCGGGGGC---G---AcAG-CCC-G GTGAGACCACCTGGg--TTTCTGTCAG-------GCC-CCGTGGAAT-CA TT---GA-TCCTCTG-TCCCTCTGGATC-GGAG-GCCTGCAT-GTaCATC CTCAAAGGAGGGTGTATgTGCAGCCTACCAGGGG-AAC-GCGCCAGGCCC GGAAGGGAGCAACGAC-ACCCTGG-ACTCTCG-ATGCTGGAGGGGT-G-C GGGGGTGAG--AG-GAAGCGGGGG-GTAC----CTGGCAGGAC---GCCC AGACCGAACC-GGGTGTGTCTGG  
40 TACID1_Thermoplasma_acidophilu  35.8%  CCAGACTTGGCC-GGGGGG---TTAGGCG-TCCCCTGT------------ ----A--CCCGAA----GTCTAGATGCGGGGGC---G---AcAG-CCC-G GTGAGACCACCTGGg--TTTCTGCCAG-------GCC-CTGCGGAAT-CA AT---GA-TCTCCTG-TCCCTCTGGATC-GGAG-GCCCATGG-ACaCGAT CTCAAAGGAGAACGCGCcCATGGCTTGCCAGGGG-AAC-GCGCCAGGCCC GGAAGGGAGCAACGAC-ACCCTGG-ACTCTCG-ATGCTGGAGGGGT-G-C GGGGGTGAG--AG-GAAACAGGGG-GTAC----CTGACAGGAC---GCCC AGACCGAACC-GGGTGTGTCTGG  
41 TC7SRNA_Tceler_7S_RNA_gene      36.8%  --GGGCTAGGCC-GGGGGG---TTCGGCG-TCCCCTGT------------ ----A-ACCGGAAAC-CGTCGATACGCCGGGGC-C-G---A-AG-CCCGG GGGGCGGTTCCCG---AAGCCGTTCCCGG---AAGCC-GGGGCACAA-CG GT---GA-TCCCTCG-TCCCACGGGGCC-GGCG-GTGGGCGG-GGtCCGG CTGGAGGGCCGGGCTAA-CGCCCTTTGCCCGCCG-AACCCCGTCAGGCCC GGAAGGGAGCAGCGGT-AGGCGGG-ACGTTCG-GCGCTCGTGGGGTAG-C GGGGGTGAG--C--GAGCCCCGGT-GGAA----GGGGACGGTGG--AGGG TCCCCACCCCCGGGCGCGCCC--  

MView 1.41, Copyright © Nigel P. Brown, 1997-1999.